Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm20939L7N243 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm20939L7N243 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm20939L7N243 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm20939L7N243 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm20939L7N243 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20939L7N243 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20939L7N243 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20939L7N243 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20939L7N243 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20939L7N243 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20939L7N243 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20939L7N243 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20939L7N243 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20939L7N243 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20939L7N243 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20939L7N243 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20939L7N243 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20939L7N243 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20939L7N243 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20939L7N243 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20939L7N243 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20939L7N243 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20939L7N243 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm20939L7N243 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm20939L7N243 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm20939L7N243 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm20939L7N243 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm20939L7N243 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm20939L7N243 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm20939L7N243 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm20939L7N243 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm20939L7N243 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm20939L7N243 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm20939L7N243 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm20939L7N243 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm20939L7N243 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm20939L7N243 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm20939L7N243 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm20939L7N243 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20939L7N243 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20939L7N243 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20939L7N243 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20939L7N243 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20939L7N243 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20939L7N243 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20939L7N243 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20939L7N243 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20939L7N243 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20939L7N243 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20939L7N243 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20939L7N243 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20939L7N243 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20939L7N243 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20939L7N243 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20939L7N243 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm20939L7N243 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm20939L7N243 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm20939L7N243 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm20939L7N243 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm20939L7N243 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm20939L7N243 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm20939L7N243 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm20939L7N243 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm20939L7N243 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm20939L7N243 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm20939L7N243 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm20939L7N243 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm20939L7N243 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm20939L7N243 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm20939L7N243 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm20939L7N243 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm20939L7N243 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm20939L7N243 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm20939L7N243 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm20939L7N243 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm20939L7N243 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm20939L7N243 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm20939L7N243 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm20939L7N243 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm20939L7N243 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm20939L7N243 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm20939L7N243 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm20939L7N243 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm20939L7N243 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm20939L7N243 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm20939L7N243 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm20939L7N243 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm20939L7N243 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm20939L7N243 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm20939L7N243 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm20939L7N243 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm20939L7N243 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm20939L7N243 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm20939L7N243 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm20939L7N243 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm20939L7N243 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm20939L7N243 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm20939L7N243 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm20939L7N243 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 227.5 ms