Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm21887J3QQ04 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm21887J3QQ04 Gm20825-201ENSMUST00000178149 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm21887J3QQ04 Gm28064-201ENSMUST00000185639 858 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm21887J3QQ04 Olfr1460-ps1-201ENSMUST00000208975 899 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm21887J3QQ04 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm21887J3QQ04 AC172027.1-201ENSMUST00000217659 337 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm21887J3QQ04 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm21887J3QQ04 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm21887J3QQ04 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm21887J3QQ04 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm21887J3QQ04 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm21887J3QQ04 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm21887J3QQ04 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm21887J3QQ04 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm21887J3QQ04 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm21887J3QQ04 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm21887J3QQ04 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm21887J3QQ04 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm21887J3QQ04 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Gm21887J3QQ04 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Gm21887J3QQ04 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Gm21887J3QQ04 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Gm21887J3QQ04 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm21887J3QQ04 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm21887J3QQ04 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm21887J3QQ04 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm21887J3QQ04 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm21887J3QQ04 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm21887J3QQ04 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm21887J3QQ04 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm21887J3QQ04 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm21887J3QQ04 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm21887J3QQ04 Gm4214-201ENSMUST00000174451 960 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm21887J3QQ04 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm21887J3QQ04 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm21887J3QQ04 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm21887J3QQ04 Gm17540-201ENSMUST00000181617 1528 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm21887J3QQ04 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm21887J3QQ04 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm21887J3QQ04 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm21887J3QQ04 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm21887J3QQ04 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm21887J3QQ04 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm21887J3QQ04 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm21887J3QQ04 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm21887J3QQ04 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm21887J3QQ04 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm21887J3QQ04 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm21887J3QQ04 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm21887J3QQ04 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm21887J3QQ04 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm21887J3QQ04 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm21887J3QQ04 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm21887J3QQ04 Gm6546-201ENSMUST00000192096 766 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm21887J3QQ04 Id2-201ENSMUST00000020974 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm21887J3QQ04 AC106830.1-201ENSMUST00000228032 1003 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm21887J3QQ04 Ccl25-201ENSMUST00000024004 1058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm21887J3QQ04 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm21887J3QQ04 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm21887J3QQ04 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm21887J3QQ04 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm21887J3QQ04 Mndal-202ENSMUST00000186442 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm21887J3QQ04 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm21887J3QQ04 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm21887J3QQ04 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm21887J3QQ04 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm21887J3QQ04 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm21887J3QQ04 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm21887J3QQ04 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm21887J3QQ04 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm21887J3QQ04 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm21887J3QQ04 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm21887J3QQ04 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm21887J3QQ04 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm21887J3QQ04 Gm24541-201ENSMUST00000103871 96 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm21887J3QQ04 Gm12439-201ENSMUST00000117162 365 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm21887J3QQ04 Gm15171-201ENSMUST00000122191 334 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm21887J3QQ04 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm21887J3QQ04 Gm6098-201ENSMUST00000180234 330 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm21887J3QQ04 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm21887J3QQ04 Trdn-202ENSMUST00000217779 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm21887J3QQ04 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm21887J3QQ04 BC028528-202ENSMUST00000090476 809 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm21887J3QQ04 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm21887J3QQ04 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm21887J3QQ04 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm21887J3QQ04 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm21887J3QQ04 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm21887J3QQ04 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm21887J3QQ04 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm21887J3QQ04 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm21887J3QQ04 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm21887J3QQ04 CT009495.1-201ENSMUST00000224221 862 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm21887J3QQ04 Prl8a1-201ENSMUST00000006664 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm21887J3QQ04 AC154806.5-202ENSMUST00000227217 1443 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm21887J3QQ04 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm21887J3QQ04 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm21887J3QQ04 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm21887J3QQ04 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms