Protein–RNA interactions for Protein: J3QPX0

5730507C01Rik, RIKEN cDNA 5730507C01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5730507C01RikJ3QPX0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
5730507C01RikJ3QPX0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
5730507C01RikJ3QPX0 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
5730507C01RikJ3QPX0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
5730507C01RikJ3QPX0 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
5730507C01RikJ3QPX0 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
5730507C01RikJ3QPX0 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
5730507C01RikJ3QPX0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
5730507C01RikJ3QPX0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
5730507C01RikJ3QPX0 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
5730507C01RikJ3QPX0 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
5730507C01RikJ3QPX0 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
5730507C01RikJ3QPX0 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
5730507C01RikJ3QPX0 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
5730507C01RikJ3QPX0 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
5730507C01RikJ3QPX0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
5730507C01RikJ3QPX0 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
5730507C01RikJ3QPX0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
5730507C01RikJ3QPX0 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
5730507C01RikJ3QPX0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
5730507C01RikJ3QPX0 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
5730507C01RikJ3QPX0 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
5730507C01RikJ3QPX0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
5730507C01RikJ3QPX0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
5730507C01RikJ3QPX0 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
5730507C01RikJ3QPX0 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
5730507C01RikJ3QPX0 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
5730507C01RikJ3QPX0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
5730507C01RikJ3QPX0 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
5730507C01RikJ3QPX0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
5730507C01RikJ3QPX0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
5730507C01RikJ3QPX0 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
5730507C01RikJ3QPX0 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
5730507C01RikJ3QPX0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
5730507C01RikJ3QPX0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
5730507C01RikJ3QPX0 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
5730507C01RikJ3QPX0 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
5730507C01RikJ3QPX0 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
5730507C01RikJ3QPX0 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
5730507C01RikJ3QPX0 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
5730507C01RikJ3QPX0 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
5730507C01RikJ3QPX0 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
5730507C01RikJ3QPX0 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
5730507C01RikJ3QPX0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
5730507C01RikJ3QPX0 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
5730507C01RikJ3QPX0 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
5730507C01RikJ3QPX0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
5730507C01RikJ3QPX0 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
5730507C01RikJ3QPX0 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
5730507C01RikJ3QPX0 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
5730507C01RikJ3QPX0 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
5730507C01RikJ3QPX0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
5730507C01RikJ3QPX0 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
5730507C01RikJ3QPX0 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
5730507C01RikJ3QPX0 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
5730507C01RikJ3QPX0 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
5730507C01RikJ3QPX0 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
5730507C01RikJ3QPX0 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
5730507C01RikJ3QPX0 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
5730507C01RikJ3QPX0 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
5730507C01RikJ3QPX0 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
5730507C01RikJ3QPX0 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
5730507C01RikJ3QPX0 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
5730507C01RikJ3QPX0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
5730507C01RikJ3QPX0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
5730507C01RikJ3QPX0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
5730507C01RikJ3QPX0 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
5730507C01RikJ3QPX0 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
5730507C01RikJ3QPX0 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
5730507C01RikJ3QPX0 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
5730507C01RikJ3QPX0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
5730507C01RikJ3QPX0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
5730507C01RikJ3QPX0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
5730507C01RikJ3QPX0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
5730507C01RikJ3QPX0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
5730507C01RikJ3QPX0 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
5730507C01RikJ3QPX0 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
5730507C01RikJ3QPX0 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
5730507C01RikJ3QPX0 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
5730507C01RikJ3QPX0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
5730507C01RikJ3QPX0 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
5730507C01RikJ3QPX0 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
5730507C01RikJ3QPX0 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
5730507C01RikJ3QPX0 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
5730507C01RikJ3QPX0 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
5730507C01RikJ3QPX0 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
5730507C01RikJ3QPX0 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
5730507C01RikJ3QPX0 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
5730507C01RikJ3QPX0 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
5730507C01RikJ3QPX0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
5730507C01RikJ3QPX0 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
5730507C01RikJ3QPX0 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
5730507C01RikJ3QPX0 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
5730507C01RikJ3QPX0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
5730507C01RikJ3QPX0 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
5730507C01RikJ3QPX0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
5730507C01RikJ3QPX0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
5730507C01RikJ3QPX0 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
5730507C01RikJ3QPX0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
5730507C01RikJ3QPX0 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms