Protein–RNA interactions for Protein: J3QMA4

Zfp870, Zinc finger protein 870, mousemouse

Predictions only

Length 560 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp870J3QMA4 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Zfp870J3QMA4 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Zfp870J3QMA4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Zfp870J3QMA4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Zfp870J3QMA4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zfp870J3QMA4 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zfp870J3QMA4 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zfp870J3QMA4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zfp870J3QMA4 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zfp870J3QMA4 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zfp870J3QMA4 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zfp870J3QMA4 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zfp870J3QMA4 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zfp870J3QMA4 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zfp870J3QMA4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zfp870J3QMA4 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zfp870J3QMA4 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zfp870J3QMA4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zfp870J3QMA4 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Zfp870J3QMA4 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zfp870J3QMA4 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zfp870J3QMA4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zfp870J3QMA4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zfp870J3QMA4 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zfp870J3QMA4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zfp870J3QMA4 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zfp870J3QMA4 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zfp870J3QMA4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zfp870J3QMA4 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zfp870J3QMA4 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Zfp870J3QMA4 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zfp870J3QMA4 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zfp870J3QMA4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zfp870J3QMA4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zfp870J3QMA4 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zfp870J3QMA4 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zfp870J3QMA4 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zfp870J3QMA4 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Zfp870J3QMA4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zfp870J3QMA4 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zfp870J3QMA4 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zfp870J3QMA4 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zfp870J3QMA4 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Zfp870J3QMA4 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zfp870J3QMA4 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zfp870J3QMA4 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zfp870J3QMA4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zfp870J3QMA4 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zfp870J3QMA4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zfp870J3QMA4 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Zfp870J3QMA4 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Zfp870J3QMA4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Zfp870J3QMA4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Zfp870J3QMA4 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Zfp870J3QMA4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Zfp870J3QMA4 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Zfp870J3QMA4 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Zfp870J3QMA4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Zfp870J3QMA4 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Zfp870J3QMA4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Zfp870J3QMA4 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Zfp870J3QMA4 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zfp870J3QMA4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zfp870J3QMA4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zfp870J3QMA4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zfp870J3QMA4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zfp870J3QMA4 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zfp870J3QMA4 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zfp870J3QMA4 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zfp870J3QMA4 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Zfp870J3QMA4 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Zfp870J3QMA4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Zfp870J3QMA4 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Zfp870J3QMA4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Zfp870J3QMA4 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Zfp870J3QMA4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zfp870J3QMA4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zfp870J3QMA4 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zfp870J3QMA4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zfp870J3QMA4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zfp870J3QMA4 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zfp870J3QMA4 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zfp870J3QMA4 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zfp870J3QMA4 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zfp870J3QMA4 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zfp870J3QMA4 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zfp870J3QMA4 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zfp870J3QMA4 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zfp870J3QMA4 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zfp870J3QMA4 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zfp870J3QMA4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zfp870J3QMA4 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zfp870J3QMA4 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zfp870J3QMA4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zfp870J3QMA4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zfp870J3QMA4 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zfp870J3QMA4 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zfp870J3QMA4 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zfp870J3QMA4 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zfp870J3QMA4 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms