Protein–RNA interactions for Protein: J3QMA2

Gm28051, Predicted gene, 28051, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28051J3QMA2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm28051J3QMA2 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm28051J3QMA2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm28051J3QMA2 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm28051J3QMA2 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm28051J3QMA2 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm28051J3QMA2 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm28051J3QMA2 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm28051J3QMA2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm28051J3QMA2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm28051J3QMA2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm28051J3QMA2 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm28051J3QMA2 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm28051J3QMA2 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm28051J3QMA2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm28051J3QMA2 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm28051J3QMA2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm28051J3QMA2 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm28051J3QMA2 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm28051J3QMA2 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm28051J3QMA2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm28051J3QMA2 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm28051J3QMA2 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm28051J3QMA2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm28051J3QMA2 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm28051J3QMA2 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm28051J3QMA2 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm28051J3QMA2 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm28051J3QMA2 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm28051J3QMA2 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm28051J3QMA2 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm28051J3QMA2 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm28051J3QMA2 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm28051J3QMA2 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm28051J3QMA2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm28051J3QMA2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm28051J3QMA2 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm28051J3QMA2 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm28051J3QMA2 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm28051J3QMA2 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm28051J3QMA2 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm28051J3QMA2 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm28051J3QMA2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm28051J3QMA2 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm28051J3QMA2 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm28051J3QMA2 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm28051J3QMA2 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm28051J3QMA2 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm28051J3QMA2 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm28051J3QMA2 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm28051J3QMA2 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm28051J3QMA2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm28051J3QMA2 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm28051J3QMA2 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm28051J3QMA2 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm28051J3QMA2 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm28051J3QMA2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm28051J3QMA2 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm28051J3QMA2 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm28051J3QMA2 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm28051J3QMA2 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm28051J3QMA2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm28051J3QMA2 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm28051J3QMA2 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm28051J3QMA2 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm28051J3QMA2 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm28051J3QMA2 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm28051J3QMA2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm28051J3QMA2 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm28051J3QMA2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm28051J3QMA2 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm28051J3QMA2 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm28051J3QMA2 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm28051J3QMA2 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm28051J3QMA2 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm28051J3QMA2 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm28051J3QMA2 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm28051J3QMA2 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm28051J3QMA2 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm28051J3QMA2 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm28051J3QMA2 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm28051J3QMA2 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm28051J3QMA2 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm28051J3QMA2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm28051J3QMA2 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm28051J3QMA2 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm28051J3QMA2 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm28051J3QMA2 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm28051J3QMA2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm28051J3QMA2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm28051J3QMA2 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm28051J3QMA2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm28051J3QMA2 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm28051J3QMA2 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm28051J3QMA2 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm28051J3QMA2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm28051J3QMA2 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm28051J3QMA2 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm28051J3QMA2 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm28051J3QMA2 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms