Protein–RNA interactions for Protein: I3ITR1

AK157302, MCG50313, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AK157302I3ITR1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
AK157302I3ITR1 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
AK157302I3ITR1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
AK157302I3ITR1 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
AK157302I3ITR1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
AK157302I3ITR1 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
AK157302I3ITR1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
AK157302I3ITR1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
AK157302I3ITR1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
AK157302I3ITR1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
AK157302I3ITR1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
AK157302I3ITR1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
AK157302I3ITR1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
AK157302I3ITR1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
AK157302I3ITR1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
AK157302I3ITR1 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
AK157302I3ITR1 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
AK157302I3ITR1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
AK157302I3ITR1 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
AK157302I3ITR1 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
AK157302I3ITR1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
AK157302I3ITR1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
AK157302I3ITR1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
AK157302I3ITR1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
AK157302I3ITR1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
AK157302I3ITR1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
AK157302I3ITR1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
AK157302I3ITR1 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
AK157302I3ITR1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
AK157302I3ITR1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
AK157302I3ITR1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
AK157302I3ITR1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
AK157302I3ITR1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
AK157302I3ITR1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
AK157302I3ITR1 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
AK157302I3ITR1 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AK157302I3ITR1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
AK157302I3ITR1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AK157302I3ITR1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AK157302I3ITR1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AK157302I3ITR1 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
AK157302I3ITR1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AK157302I3ITR1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
AK157302I3ITR1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
AK157302I3ITR1 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
AK157302I3ITR1 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
AK157302I3ITR1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
AK157302I3ITR1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AK157302I3ITR1 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC25■■□□□ 1.59
AK157302I3ITR1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AK157302I3ITR1 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AK157302I3ITR1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AK157302I3ITR1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AK157302I3ITR1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AK157302I3ITR1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AK157302I3ITR1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AK157302I3ITR1 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
AK157302I3ITR1 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
AK157302I3ITR1 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
AK157302I3ITR1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
AK157302I3ITR1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AK157302I3ITR1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AK157302I3ITR1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AK157302I3ITR1 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AK157302I3ITR1 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AK157302I3ITR1 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
AK157302I3ITR1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
AK157302I3ITR1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AK157302I3ITR1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
AK157302I3ITR1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AK157302I3ITR1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AK157302I3ITR1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AK157302I3ITR1 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
AK157302I3ITR1 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
AK157302I3ITR1 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
AK157302I3ITR1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
AK157302I3ITR1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
AK157302I3ITR1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
AK157302I3ITR1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
AK157302I3ITR1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
AK157302I3ITR1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
AK157302I3ITR1 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
AK157302I3ITR1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
AK157302I3ITR1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
AK157302I3ITR1 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
AK157302I3ITR1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
AK157302I3ITR1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
AK157302I3ITR1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
AK157302I3ITR1 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
AK157302I3ITR1 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
AK157302I3ITR1 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
AK157302I3ITR1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
AK157302I3ITR1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
AK157302I3ITR1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
AK157302I3ITR1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
AK157302I3ITR1 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
AK157302I3ITR1 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AK157302I3ITR1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AK157302I3ITR1 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AK157302I3ITR1 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms