Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Taf4bG5E8Z2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Taf4bG5E8Z2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Taf4bG5E8Z2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Taf4bG5E8Z2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Taf4bG5E8Z2 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Taf4bG5E8Z2 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Taf4bG5E8Z2 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Taf4bG5E8Z2 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Taf4bG5E8Z2 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Taf4bG5E8Z2 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Taf4bG5E8Z2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Taf4bG5E8Z2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Taf4bG5E8Z2 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Taf4bG5E8Z2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Taf4bG5E8Z2 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Taf4bG5E8Z2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Taf4bG5E8Z2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Taf4bG5E8Z2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Taf4bG5E8Z2 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Taf4bG5E8Z2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Taf4bG5E8Z2 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Taf4bG5E8Z2 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Taf4bG5E8Z2 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Taf4bG5E8Z2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Taf4bG5E8Z2 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Taf4bG5E8Z2 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Taf4bG5E8Z2 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Taf4bG5E8Z2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Taf4bG5E8Z2 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Taf4bG5E8Z2 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Taf4bG5E8Z2 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Taf4bG5E8Z2 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Taf4bG5E8Z2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Taf4bG5E8Z2 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Taf4bG5E8Z2 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Taf4bG5E8Z2 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Taf4bG5E8Z2 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Taf4bG5E8Z2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Taf4bG5E8Z2 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Taf4bG5E8Z2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Taf4bG5E8Z2 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Taf4bG5E8Z2 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Taf4bG5E8Z2 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Taf4bG5E8Z2 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Taf4bG5E8Z2 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Taf4bG5E8Z2 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Taf4bG5E8Z2 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Taf4bG5E8Z2 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Taf4bG5E8Z2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Taf4bG5E8Z2 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Taf4bG5E8Z2 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Taf4bG5E8Z2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Taf4bG5E8Z2 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Taf4bG5E8Z2 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Taf4bG5E8Z2 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Taf4bG5E8Z2 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Taf4bG5E8Z2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Taf4bG5E8Z2 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Taf4bG5E8Z2 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Taf4bG5E8Z2 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Taf4bG5E8Z2 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Taf4bG5E8Z2 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Taf4bG5E8Z2 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Taf4bG5E8Z2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Taf4bG5E8Z2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Taf4bG5E8Z2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Taf4bG5E8Z2 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Taf4bG5E8Z2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Taf4bG5E8Z2 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Taf4bG5E8Z2 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Taf4bG5E8Z2 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Taf4bG5E8Z2 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Taf4bG5E8Z2 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Taf4bG5E8Z2 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Taf4bG5E8Z2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Taf4bG5E8Z2 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Taf4bG5E8Z2 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Taf4bG5E8Z2 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Taf4bG5E8Z2 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Taf4bG5E8Z2 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Taf4bG5E8Z2 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Taf4bG5E8Z2 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Taf4bG5E8Z2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Taf4bG5E8Z2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Taf4bG5E8Z2 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Taf4bG5E8Z2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Taf4bG5E8Z2 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Taf4bG5E8Z2 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Taf4bG5E8Z2 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Taf4bG5E8Z2 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Taf4bG5E8Z2 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Taf4bG5E8Z2 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Taf4bG5E8Z2 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Taf4bG5E8Z2 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Taf4bG5E8Z2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Taf4bG5E8Z2 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Taf4bG5E8Z2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Taf4bG5E8Z2 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Taf4bG5E8Z2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms