Protein–RNA interactions for Protein: G5E8P0

Tubgcp6, Gamma-tubulin complex component 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp6G5E8P0 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Tubgcp6G5E8P0 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Tubgcp6G5E8P0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Tubgcp6G5E8P0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Tubgcp6G5E8P0 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Tubgcp6G5E8P0 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Tubgcp6G5E8P0 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Tubgcp6G5E8P0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Tubgcp6G5E8P0 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Tubgcp6G5E8P0 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Tubgcp6G5E8P0 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Tubgcp6G5E8P0 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Tubgcp6G5E8P0 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Tubgcp6G5E8P0 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Tubgcp6G5E8P0 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Tubgcp6G5E8P0 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Tubgcp6G5E8P0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Tubgcp6G5E8P0 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Tubgcp6G5E8P0 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Tubgcp6G5E8P0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Tubgcp6G5E8P0 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Tubgcp6G5E8P0 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Tubgcp6G5E8P0 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Tubgcp6G5E8P0 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Tubgcp6G5E8P0 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Tubgcp6G5E8P0 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Tubgcp6G5E8P0 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Tubgcp6G5E8P0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Tubgcp6G5E8P0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Tubgcp6G5E8P0 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Tubgcp6G5E8P0 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Tubgcp6G5E8P0 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Tubgcp6G5E8P0 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Tubgcp6G5E8P0 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Tubgcp6G5E8P0 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Tubgcp6G5E8P0 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Tubgcp6G5E8P0 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Tubgcp6G5E8P0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Tubgcp6G5E8P0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Tubgcp6G5E8P0 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Tubgcp6G5E8P0 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Tubgcp6G5E8P0 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Tubgcp6G5E8P0 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Tubgcp6G5E8P0 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Tubgcp6G5E8P0 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Tubgcp6G5E8P0 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Tubgcp6G5E8P0 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Tubgcp6G5E8P0 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Tubgcp6G5E8P0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Tubgcp6G5E8P0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Tubgcp6G5E8P0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Tubgcp6G5E8P0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Tubgcp6G5E8P0 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Tubgcp6G5E8P0 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Tubgcp6G5E8P0 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Tubgcp6G5E8P0 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Tubgcp6G5E8P0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Tubgcp6G5E8P0 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Tubgcp6G5E8P0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Tubgcp6G5E8P0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Tubgcp6G5E8P0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Tubgcp6G5E8P0 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Tubgcp6G5E8P0 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Tubgcp6G5E8P0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
Tubgcp6G5E8P0 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Tubgcp6G5E8P0 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Tubgcp6G5E8P0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Tubgcp6G5E8P0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Tubgcp6G5E8P0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Tubgcp6G5E8P0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Tubgcp6G5E8P0 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Tubgcp6G5E8P0 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Tubgcp6G5E8P0 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Tubgcp6G5E8P0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Tubgcp6G5E8P0 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Tubgcp6G5E8P0 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Tubgcp6G5E8P0 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Tubgcp6G5E8P0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Tubgcp6G5E8P0 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Tubgcp6G5E8P0 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Tubgcp6G5E8P0 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Tubgcp6G5E8P0 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Tubgcp6G5E8P0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Tubgcp6G5E8P0 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Tubgcp6G5E8P0 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Tubgcp6G5E8P0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Tubgcp6G5E8P0 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Tubgcp6G5E8P0 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Tubgcp6G5E8P0 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Tubgcp6G5E8P0 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Tubgcp6G5E8P0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Tubgcp6G5E8P0 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Tubgcp6G5E8P0 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Tubgcp6G5E8P0 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Tubgcp6G5E8P0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Tubgcp6G5E8P0 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Tubgcp6G5E8P0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Tubgcp6G5E8P0 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Tubgcp6G5E8P0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Tubgcp6G5E8P0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms