Protein–RNA interactions for Protein: G5E861

Sclt1, Sodium channel and clathrin linker 1, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sclt1G5E861 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sclt1G5E861 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sclt1G5E861 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sclt1G5E861 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sclt1G5E861 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sclt1G5E861 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sclt1G5E861 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Sclt1G5E861 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sclt1G5E861 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sclt1G5E861 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sclt1G5E861 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sclt1G5E861 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sclt1G5E861 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sclt1G5E861 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Sclt1G5E861 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sclt1G5E861 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sclt1G5E861 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sclt1G5E861 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sclt1G5E861 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sclt1G5E861 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sclt1G5E861 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sclt1G5E861 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sclt1G5E861 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sclt1G5E861 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sclt1G5E861 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sclt1G5E861 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sclt1G5E861 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sclt1G5E861 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sclt1G5E861 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sclt1G5E861 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sclt1G5E861 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sclt1G5E861 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sclt1G5E861 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sclt1G5E861 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Sclt1G5E861 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sclt1G5E861 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sclt1G5E861 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Sclt1G5E861 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sclt1G5E861 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sclt1G5E861 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sclt1G5E861 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sclt1G5E861 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sclt1G5E861 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sclt1G5E861 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sclt1G5E861 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sclt1G5E861 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Sclt1G5E861 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sclt1G5E861 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sclt1G5E861 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sclt1G5E861 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sclt1G5E861 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sclt1G5E861 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sclt1G5E861 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sclt1G5E861 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sclt1G5E861 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sclt1G5E861 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sclt1G5E861 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sclt1G5E861 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sclt1G5E861 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sclt1G5E861 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sclt1G5E861 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sclt1G5E861 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sclt1G5E861 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sclt1G5E861 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sclt1G5E861 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sclt1G5E861 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sclt1G5E861 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sclt1G5E861 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sclt1G5E861 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sclt1G5E861 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sclt1G5E861 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sclt1G5E861 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sclt1G5E861 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sclt1G5E861 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sclt1G5E861 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sclt1G5E861 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sclt1G5E861 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sclt1G5E861 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sclt1G5E861 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sclt1G5E861 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Sclt1G5E861 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sclt1G5E861 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sclt1G5E861 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sclt1G5E861 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sclt1G5E861 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sclt1G5E861 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sclt1G5E861 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sclt1G5E861 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sclt1G5E861 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sclt1G5E861 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sclt1G5E861 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sclt1G5E861 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sclt1G5E861 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sclt1G5E861 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sclt1G5E861 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sclt1G5E861 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sclt1G5E861 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sclt1G5E861 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sclt1G5E861 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sclt1G5E861 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms