Protein–RNA interactions for Protein: G3XA52

Vmn1r34, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r34G3XA52 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r34G3XA52 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r34G3XA52 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r34G3XA52 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r34G3XA52 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r34G3XA52 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r34G3XA52 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r34G3XA52 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r34G3XA52 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r34G3XA52 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r34G3XA52 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r34G3XA52 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r34G3XA52 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r34G3XA52 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r34G3XA52 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r34G3XA52 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r34G3XA52 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r34G3XA52 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r34G3XA52 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r34G3XA52 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r34G3XA52 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r34G3XA52 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r34G3XA52 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r34G3XA52 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r34G3XA52 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r34G3XA52 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r34G3XA52 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r34G3XA52 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r34G3XA52 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r34G3XA52 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r34G3XA52 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r34G3XA52 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r34G3XA52 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r34G3XA52 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r34G3XA52 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r34G3XA52 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r34G3XA52 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r34G3XA52 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r34G3XA52 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r34G3XA52 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r34G3XA52 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vmn1r34G3XA52 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vmn1r34G3XA52 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmn1r34G3XA52 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmn1r34G3XA52 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmn1r34G3XA52 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmn1r34G3XA52 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmn1r34G3XA52 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmn1r34G3XA52 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmn1r34G3XA52 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmn1r34G3XA52 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmn1r34G3XA52 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn1r34G3XA52 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn1r34G3XA52 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn1r34G3XA52 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn1r34G3XA52 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn1r34G3XA52 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn1r34G3XA52 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn1r34G3XA52 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn1r34G3XA52 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn1r34G3XA52 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn1r34G3XA52 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn1r34G3XA52 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn1r34G3XA52 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn1r34G3XA52 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn1r34G3XA52 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn1r34G3XA52 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn1r34G3XA52 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn1r34G3XA52 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn1r34G3XA52 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn1r34G3XA52 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn1r34G3XA52 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r34G3XA52 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r34G3XA52 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r34G3XA52 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r34G3XA52 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r34G3XA52 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r34G3XA52 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r34G3XA52 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r34G3XA52 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r34G3XA52 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r34G3XA52 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r34G3XA52 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r34G3XA52 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r34G3XA52 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r34G3XA52 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r34G3XA52 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r34G3XA52 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r34G3XA52 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r34G3XA52 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r34G3XA52 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r34G3XA52 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r34G3XA52 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r34G3XA52 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r34G3XA52 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r34G3XA52 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r34G3XA52 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r34G3XA52 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r34G3XA52 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r34G3XA52 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms