Protein–RNA interactions for Protein: G3X9F6

Sh3tc1, SH3 domain and tetratricopeptide repeats 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3tc1G3X9F6 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sh3tc1G3X9F6 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sh3tc1G3X9F6 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sh3tc1G3X9F6 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sh3tc1G3X9F6 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sh3tc1G3X9F6 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sh3tc1G3X9F6 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sh3tc1G3X9F6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sh3tc1G3X9F6 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sh3tc1G3X9F6 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sh3tc1G3X9F6 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sh3tc1G3X9F6 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Sh3tc1G3X9F6 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sh3tc1G3X9F6 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sh3tc1G3X9F6 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sh3tc1G3X9F6 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sh3tc1G3X9F6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sh3tc1G3X9F6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sh3tc1G3X9F6 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Sh3tc1G3X9F6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Sh3tc1G3X9F6 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sh3tc1G3X9F6 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sh3tc1G3X9F6 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sh3tc1G3X9F6 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sh3tc1G3X9F6 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sh3tc1G3X9F6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sh3tc1G3X9F6 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sh3tc1G3X9F6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sh3tc1G3X9F6 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sh3tc1G3X9F6 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sh3tc1G3X9F6 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sh3tc1G3X9F6 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sh3tc1G3X9F6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sh3tc1G3X9F6 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Sh3tc1G3X9F6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sh3tc1G3X9F6 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sh3tc1G3X9F6 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sh3tc1G3X9F6 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sh3tc1G3X9F6 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sh3tc1G3X9F6 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sh3tc1G3X9F6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sh3tc1G3X9F6 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sh3tc1G3X9F6 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sh3tc1G3X9F6 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Sh3tc1G3X9F6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sh3tc1G3X9F6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sh3tc1G3X9F6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sh3tc1G3X9F6 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sh3tc1G3X9F6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sh3tc1G3X9F6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sh3tc1G3X9F6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sh3tc1G3X9F6 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sh3tc1G3X9F6 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Sh3tc1G3X9F6 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sh3tc1G3X9F6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sh3tc1G3X9F6 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sh3tc1G3X9F6 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sh3tc1G3X9F6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sh3tc1G3X9F6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sh3tc1G3X9F6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sh3tc1G3X9F6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sh3tc1G3X9F6 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Sh3tc1G3X9F6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sh3tc1G3X9F6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sh3tc1G3X9F6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sh3tc1G3X9F6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sh3tc1G3X9F6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sh3tc1G3X9F6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Sh3tc1G3X9F6 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sh3tc1G3X9F6 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Sh3tc1G3X9F6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sh3tc1G3X9F6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sh3tc1G3X9F6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sh3tc1G3X9F6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sh3tc1G3X9F6 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sh3tc1G3X9F6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sh3tc1G3X9F6 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sh3tc1G3X9F6 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sh3tc1G3X9F6 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sh3tc1G3X9F6 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Sh3tc1G3X9F6 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sh3tc1G3X9F6 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sh3tc1G3X9F6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sh3tc1G3X9F6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sh3tc1G3X9F6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sh3tc1G3X9F6 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sh3tc1G3X9F6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sh3tc1G3X9F6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sh3tc1G3X9F6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sh3tc1G3X9F6 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sh3tc1G3X9F6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sh3tc1G3X9F6 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sh3tc1G3X9F6 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sh3tc1G3X9F6 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Sh3tc1G3X9F6 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sh3tc1G3X9F6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sh3tc1G3X9F6 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sh3tc1G3X9F6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sh3tc1G3X9F6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sh3tc1G3X9F6 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms