Protein–RNA interactions for Protein: G3X952

Zkscan2, MCG20985, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zkscan2G3X952 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Zkscan2G3X952 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Zkscan2G3X952 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Zkscan2G3X952 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Zkscan2G3X952 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Zkscan2G3X952 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Zkscan2G3X952 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Zkscan2G3X952 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Zkscan2G3X952 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Zkscan2G3X952 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Zkscan2G3X952 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Zkscan2G3X952 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Zkscan2G3X952 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Zkscan2G3X952 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Zkscan2G3X952 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Zkscan2G3X952 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Zkscan2G3X952 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Zkscan2G3X952 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Zkscan2G3X952 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Zkscan2G3X952 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Zkscan2G3X952 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Zkscan2G3X952 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Zkscan2G3X952 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Zkscan2G3X952 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Zkscan2G3X952 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Zkscan2G3X952 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Zkscan2G3X952 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Zkscan2G3X952 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Zkscan2G3X952 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Zkscan2G3X952 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Zkscan2G3X952 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Zkscan2G3X952 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Zkscan2G3X952 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Zkscan2G3X952 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Zkscan2G3X952 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Zkscan2G3X952 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Zkscan2G3X952 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Zkscan2G3X952 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Zkscan2G3X952 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Zkscan2G3X952 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Zkscan2G3X952 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Zkscan2G3X952 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Zkscan2G3X952 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Zkscan2G3X952 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Zkscan2G3X952 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Zkscan2G3X952 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Zkscan2G3X952 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Zkscan2G3X952 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Zkscan2G3X952 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Zkscan2G3X952 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Zkscan2G3X952 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Zkscan2G3X952 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Zkscan2G3X952 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Zkscan2G3X952 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Zkscan2G3X952 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Zkscan2G3X952 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Zkscan2G3X952 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Zkscan2G3X952 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Zkscan2G3X952 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Zkscan2G3X952 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Zkscan2G3X952 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Zkscan2G3X952 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Zkscan2G3X952 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Zkscan2G3X952 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Zkscan2G3X952 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Zkscan2G3X952 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Zkscan2G3X952 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Zkscan2G3X952 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Zkscan2G3X952 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Zkscan2G3X952 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Zkscan2G3X952 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Zkscan2G3X952 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Zkscan2G3X952 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Zkscan2G3X952 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Zkscan2G3X952 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Zkscan2G3X952 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Zkscan2G3X952 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Zkscan2G3X952 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Zkscan2G3X952 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Zkscan2G3X952 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Zkscan2G3X952 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Zkscan2G3X952 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Zkscan2G3X952 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Zkscan2G3X952 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Zkscan2G3X952 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Zkscan2G3X952 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Zkscan2G3X952 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Zkscan2G3X952 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Zkscan2G3X952 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Zkscan2G3X952 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Zkscan2G3X952 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Zkscan2G3X952 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Zkscan2G3X952 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Zkscan2G3X952 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Zkscan2G3X952 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Zkscan2G3X952 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Zkscan2G3X952 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Zkscan2G3X952 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Zkscan2G3X952 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Zkscan2G3X952 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.2 ms