Protein–RNA interactions for Protein: G3X8Y2

1810062G17Rik, MCG1049552, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1810062G17RikG3X8Y2 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1810062G17RikG3X8Y2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1810062G17RikG3X8Y2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1810062G17RikG3X8Y2 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
1810062G17RikG3X8Y2 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1810062G17RikG3X8Y2 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1810062G17RikG3X8Y2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1810062G17RikG3X8Y2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1810062G17RikG3X8Y2 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1810062G17RikG3X8Y2 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1810062G17RikG3X8Y2 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
1810062G17RikG3X8Y2 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1810062G17RikG3X8Y2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
1810062G17RikG3X8Y2 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
1810062G17RikG3X8Y2 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1810062G17RikG3X8Y2 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1810062G17RikG3X8Y2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1810062G17RikG3X8Y2 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1810062G17RikG3X8Y2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
1810062G17RikG3X8Y2 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1810062G17RikG3X8Y2 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
1810062G17RikG3X8Y2 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
1810062G17RikG3X8Y2 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
1810062G17RikG3X8Y2 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
1810062G17RikG3X8Y2 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1810062G17RikG3X8Y2 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1810062G17RikG3X8Y2 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1810062G17RikG3X8Y2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1810062G17RikG3X8Y2 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
1810062G17RikG3X8Y2 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1810062G17RikG3X8Y2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
1810062G17RikG3X8Y2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1810062G17RikG3X8Y2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1810062G17RikG3X8Y2 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
1810062G17RikG3X8Y2 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
1810062G17RikG3X8Y2 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
1810062G17RikG3X8Y2 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1810062G17RikG3X8Y2 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1810062G17RikG3X8Y2 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
1810062G17RikG3X8Y2 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1810062G17RikG3X8Y2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
1810062G17RikG3X8Y2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
1810062G17RikG3X8Y2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
1810062G17RikG3X8Y2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1810062G17RikG3X8Y2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1810062G17RikG3X8Y2 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
1810062G17RikG3X8Y2 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1810062G17RikG3X8Y2 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
1810062G17RikG3X8Y2 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
1810062G17RikG3X8Y2 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1810062G17RikG3X8Y2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1810062G17RikG3X8Y2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1810062G17RikG3X8Y2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1810062G17RikG3X8Y2 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1810062G17RikG3X8Y2 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1810062G17RikG3X8Y2 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
1810062G17RikG3X8Y2 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
1810062G17RikG3X8Y2 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
1810062G17RikG3X8Y2 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
1810062G17RikG3X8Y2 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1810062G17RikG3X8Y2 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
1810062G17RikG3X8Y2 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
1810062G17RikG3X8Y2 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
1810062G17RikG3X8Y2 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1810062G17RikG3X8Y2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1810062G17RikG3X8Y2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1810062G17RikG3X8Y2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1810062G17RikG3X8Y2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1810062G17RikG3X8Y2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1810062G17RikG3X8Y2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1810062G17RikG3X8Y2 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
1810062G17RikG3X8Y2 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1810062G17RikG3X8Y2 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
1810062G17RikG3X8Y2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1810062G17RikG3X8Y2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1810062G17RikG3X8Y2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1810062G17RikG3X8Y2 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1810062G17RikG3X8Y2 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
1810062G17RikG3X8Y2 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
1810062G17RikG3X8Y2 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
1810062G17RikG3X8Y2 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
1810062G17RikG3X8Y2 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1810062G17RikG3X8Y2 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1810062G17RikG3X8Y2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1810062G17RikG3X8Y2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1810062G17RikG3X8Y2 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
1810062G17RikG3X8Y2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
1810062G17RikG3X8Y2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1810062G17RikG3X8Y2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1810062G17RikG3X8Y2 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
1810062G17RikG3X8Y2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1810062G17RikG3X8Y2 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
1810062G17RikG3X8Y2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
1810062G17RikG3X8Y2 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
1810062G17RikG3X8Y2 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
1810062G17RikG3X8Y2 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
1810062G17RikG3X8Y2 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1810062G17RikG3X8Y2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
1810062G17RikG3X8Y2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1810062G17RikG3X8Y2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms