Protein–RNA interactions for Protein: F8VQM8

Xntrpc, Xndc1-transient receptor potential cation channel, subfamily C, member 2 readthrough, mousemouse

Predictions only

Length 1,264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XntrpcF8VQM8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
XntrpcF8VQM8 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
XntrpcF8VQM8 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
XntrpcF8VQM8 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
XntrpcF8VQM8 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
XntrpcF8VQM8 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
XntrpcF8VQM8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
XntrpcF8VQM8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
XntrpcF8VQM8 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
XntrpcF8VQM8 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
XntrpcF8VQM8 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
XntrpcF8VQM8 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
XntrpcF8VQM8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
XntrpcF8VQM8 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
XntrpcF8VQM8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
XntrpcF8VQM8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
XntrpcF8VQM8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
XntrpcF8VQM8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
XntrpcF8VQM8 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
XntrpcF8VQM8 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
XntrpcF8VQM8 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
XntrpcF8VQM8 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
XntrpcF8VQM8 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
XntrpcF8VQM8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
XntrpcF8VQM8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
XntrpcF8VQM8 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
XntrpcF8VQM8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
XntrpcF8VQM8 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
XntrpcF8VQM8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
XntrpcF8VQM8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
XntrpcF8VQM8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
XntrpcF8VQM8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
XntrpcF8VQM8 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
XntrpcF8VQM8 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
XntrpcF8VQM8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
XntrpcF8VQM8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
XntrpcF8VQM8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
XntrpcF8VQM8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
XntrpcF8VQM8 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
XntrpcF8VQM8 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
XntrpcF8VQM8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
XntrpcF8VQM8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
XntrpcF8VQM8 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
XntrpcF8VQM8 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
XntrpcF8VQM8 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
XntrpcF8VQM8 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
XntrpcF8VQM8 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
XntrpcF8VQM8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
XntrpcF8VQM8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
XntrpcF8VQM8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
XntrpcF8VQM8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
XntrpcF8VQM8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
XntrpcF8VQM8 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
XntrpcF8VQM8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
XntrpcF8VQM8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
XntrpcF8VQM8 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
XntrpcF8VQM8 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
XntrpcF8VQM8 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
XntrpcF8VQM8 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
XntrpcF8VQM8 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
XntrpcF8VQM8 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
XntrpcF8VQM8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
XntrpcF8VQM8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
XntrpcF8VQM8 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
XntrpcF8VQM8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
XntrpcF8VQM8 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.32■■□□□ 1
XntrpcF8VQM8 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
XntrpcF8VQM8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
XntrpcF8VQM8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
XntrpcF8VQM8 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
XntrpcF8VQM8 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
XntrpcF8VQM8 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
XntrpcF8VQM8 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
XntrpcF8VQM8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
XntrpcF8VQM8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
XntrpcF8VQM8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
XntrpcF8VQM8 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
XntrpcF8VQM8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
XntrpcF8VQM8 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
XntrpcF8VQM8 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
XntrpcF8VQM8 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
XntrpcF8VQM8 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
XntrpcF8VQM8 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
XntrpcF8VQM8 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
XntrpcF8VQM8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
XntrpcF8VQM8 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
XntrpcF8VQM8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
XntrpcF8VQM8 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
XntrpcF8VQM8 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
XntrpcF8VQM8 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
XntrpcF8VQM8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
XntrpcF8VQM8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
XntrpcF8VQM8 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
XntrpcF8VQM8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
XntrpcF8VQM8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
XntrpcF8VQM8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
XntrpcF8VQM8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
XntrpcF8VQM8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
XntrpcF8VQM8 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
XntrpcF8VQM8 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms