Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ScaperF8VQ70 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ScaperF8VQ70 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
ScaperF8VQ70 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
ScaperF8VQ70 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ScaperF8VQ70 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ScaperF8VQ70 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ScaperF8VQ70 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ScaperF8VQ70 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ScaperF8VQ70 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ScaperF8VQ70 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ScaperF8VQ70 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ScaperF8VQ70 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ScaperF8VQ70 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ScaperF8VQ70 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ScaperF8VQ70 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ScaperF8VQ70 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ScaperF8VQ70 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ScaperF8VQ70 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ScaperF8VQ70 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ScaperF8VQ70 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
ScaperF8VQ70 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ScaperF8VQ70 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ScaperF8VQ70 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
ScaperF8VQ70 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
ScaperF8VQ70 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ScaperF8VQ70 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ScaperF8VQ70 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ScaperF8VQ70 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
ScaperF8VQ70 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ScaperF8VQ70 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ScaperF8VQ70 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ScaperF8VQ70 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ScaperF8VQ70 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ScaperF8VQ70 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ScaperF8VQ70 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ScaperF8VQ70 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ScaperF8VQ70 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ScaperF8VQ70 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ScaperF8VQ70 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ScaperF8VQ70 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ScaperF8VQ70 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ScaperF8VQ70 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ScaperF8VQ70 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ScaperF8VQ70 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ScaperF8VQ70 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ScaperF8VQ70 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ScaperF8VQ70 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ScaperF8VQ70 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ScaperF8VQ70 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ScaperF8VQ70 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ScaperF8VQ70 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ScaperF8VQ70 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ScaperF8VQ70 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ScaperF8VQ70 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ScaperF8VQ70 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ScaperF8VQ70 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ScaperF8VQ70 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ScaperF8VQ70 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ScaperF8VQ70 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ScaperF8VQ70 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ScaperF8VQ70 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ScaperF8VQ70 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ScaperF8VQ70 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ScaperF8VQ70 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ScaperF8VQ70 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
ScaperF8VQ70 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ScaperF8VQ70 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ScaperF8VQ70 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ScaperF8VQ70 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ScaperF8VQ70 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ScaperF8VQ70 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ScaperF8VQ70 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ScaperF8VQ70 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ScaperF8VQ70 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ScaperF8VQ70 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ScaperF8VQ70 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ScaperF8VQ70 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ScaperF8VQ70 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ScaperF8VQ70 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ScaperF8VQ70 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ScaperF8VQ70 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ScaperF8VQ70 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ScaperF8VQ70 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ScaperF8VQ70 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ScaperF8VQ70 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ScaperF8VQ70 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ScaperF8VQ70 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ScaperF8VQ70 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ScaperF8VQ70 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ScaperF8VQ70 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ScaperF8VQ70 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ScaperF8VQ70 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ScaperF8VQ70 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ScaperF8VQ70 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ScaperF8VQ70 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ScaperF8VQ70 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ScaperF8VQ70 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ScaperF8VQ70 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ScaperF8VQ70 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms