Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp9yF8VPU6 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp9yF8VPU6 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp9yF8VPU6 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp9yF8VPU6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Usp9yF8VPU6 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Usp9yF8VPU6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Usp9yF8VPU6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp9yF8VPU6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp9yF8VPU6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp9yF8VPU6 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp9yF8VPU6 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp9yF8VPU6 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp9yF8VPU6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp9yF8VPU6 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp9yF8VPU6 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp9yF8VPU6 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp9yF8VPU6 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp9yF8VPU6 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp9yF8VPU6 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp9yF8VPU6 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp9yF8VPU6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp9yF8VPU6 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp9yF8VPU6 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp9yF8VPU6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp9yF8VPU6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp9yF8VPU6 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp9yF8VPU6 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp9yF8VPU6 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp9yF8VPU6 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp9yF8VPU6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp9yF8VPU6 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp9yF8VPU6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp9yF8VPU6 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp9yF8VPU6 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp9yF8VPU6 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp9yF8VPU6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp9yF8VPU6 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp9yF8VPU6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp9yF8VPU6 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp9yF8VPU6 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp9yF8VPU6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp9yF8VPU6 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp9yF8VPU6 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp9yF8VPU6 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp9yF8VPU6 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp9yF8VPU6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp9yF8VPU6 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp9yF8VPU6 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp9yF8VPU6 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp9yF8VPU6 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp9yF8VPU6 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp9yF8VPU6 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp9yF8VPU6 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp9yF8VPU6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp9yF8VPU6 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp9yF8VPU6 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp9yF8VPU6 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp9yF8VPU6 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp9yF8VPU6 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp9yF8VPU6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp9yF8VPU6 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp9yF8VPU6 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp9yF8VPU6 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp9yF8VPU6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp9yF8VPU6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp9yF8VPU6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp9yF8VPU6 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp9yF8VPU6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp9yF8VPU6 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp9yF8VPU6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp9yF8VPU6 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp9yF8VPU6 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp9yF8VPU6 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp9yF8VPU6 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp9yF8VPU6 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp9yF8VPU6 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp9yF8VPU6 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp9yF8VPU6 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp9yF8VPU6 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp9yF8VPU6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp9yF8VPU6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Usp9yF8VPU6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Usp9yF8VPU6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Usp9yF8VPU6 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp9yF8VPU6 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp9yF8VPU6 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp9yF8VPU6 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp9yF8VPU6 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp9yF8VPU6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp9yF8VPU6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp9yF8VPU6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp9yF8VPU6 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp9yF8VPU6 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp9yF8VPU6 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp9yF8VPU6 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp9yF8VPU6 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp9yF8VPU6 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp9yF8VPU6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp9yF8VPU6 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms