Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm28038F7BCN9 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm28038F7BCN9 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm28038F7BCN9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm28038F7BCN9 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm28038F7BCN9 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm28038F7BCN9 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm28038F7BCN9 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm28038F7BCN9 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm28038F7BCN9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm28038F7BCN9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm28038F7BCN9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm28038F7BCN9 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm28038F7BCN9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm28038F7BCN9 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm28038F7BCN9 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm28038F7BCN9 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm28038F7BCN9 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm28038F7BCN9 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm28038F7BCN9 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm28038F7BCN9 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm28038F7BCN9 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm28038F7BCN9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm28038F7BCN9 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Gm28038F7BCN9 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Gm28038F7BCN9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm28038F7BCN9 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm28038F7BCN9 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm28038F7BCN9 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm28038F7BCN9 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm28038F7BCN9 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm28038F7BCN9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Gm28038F7BCN9 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm28038F7BCN9 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm28038F7BCN9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm28038F7BCN9 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm28038F7BCN9 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm28038F7BCN9 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm28038F7BCN9 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm28038F7BCN9 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Gm28038F7BCN9 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm28038F7BCN9 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Gm28038F7BCN9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Gm28038F7BCN9 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm28038F7BCN9 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm28038F7BCN9 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm28038F7BCN9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Gm28038F7BCN9 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm28038F7BCN9 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm28038F7BCN9 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm28038F7BCN9 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm28038F7BCN9 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm28038F7BCN9 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm28038F7BCN9 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm28038F7BCN9 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm28038F7BCN9 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm28038F7BCN9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm28038F7BCN9 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm28038F7BCN9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm28038F7BCN9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm28038F7BCN9 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm28038F7BCN9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm28038F7BCN9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm28038F7BCN9 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm28038F7BCN9 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm28038F7BCN9 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm28038F7BCN9 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm28038F7BCN9 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm28038F7BCN9 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm28038F7BCN9 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm28038F7BCN9 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm28038F7BCN9 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm28038F7BCN9 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm28038F7BCN9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm28038F7BCN9 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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