Protein–RNA interactions for Protein: F6XQQ1

Gm10378, Predicted gene 10378 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10378F6XQQ1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm10378F6XQQ1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm10378F6XQQ1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm10378F6XQQ1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm10378F6XQQ1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm10378F6XQQ1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm10378F6XQQ1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm10378F6XQQ1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm10378F6XQQ1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm10378F6XQQ1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm10378F6XQQ1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm10378F6XQQ1 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm10378F6XQQ1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm10378F6XQQ1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm10378F6XQQ1 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm10378F6XQQ1 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm10378F6XQQ1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm10378F6XQQ1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm10378F6XQQ1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm10378F6XQQ1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm10378F6XQQ1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm10378F6XQQ1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm10378F6XQQ1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm10378F6XQQ1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm10378F6XQQ1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm10378F6XQQ1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm10378F6XQQ1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm10378F6XQQ1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm10378F6XQQ1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm10378F6XQQ1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm10378F6XQQ1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm10378F6XQQ1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm10378F6XQQ1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm10378F6XQQ1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm10378F6XQQ1 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm10378F6XQQ1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm10378F6XQQ1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm10378F6XQQ1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm10378F6XQQ1 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm10378F6XQQ1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm10378F6XQQ1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm10378F6XQQ1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm10378F6XQQ1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm10378F6XQQ1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm10378F6XQQ1 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm10378F6XQQ1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm10378F6XQQ1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm10378F6XQQ1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm10378F6XQQ1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm10378F6XQQ1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm10378F6XQQ1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm10378F6XQQ1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm10378F6XQQ1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm10378F6XQQ1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm10378F6XQQ1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm10378F6XQQ1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm10378F6XQQ1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm10378F6XQQ1 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm10378F6XQQ1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm10378F6XQQ1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm10378F6XQQ1 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm10378F6XQQ1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm10378F6XQQ1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm10378F6XQQ1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm10378F6XQQ1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm10378F6XQQ1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm10378F6XQQ1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm10378F6XQQ1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm10378F6XQQ1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm10378F6XQQ1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm10378F6XQQ1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm10378F6XQQ1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm10378F6XQQ1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm10378F6XQQ1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm10378F6XQQ1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm10378F6XQQ1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm10378F6XQQ1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm10378F6XQQ1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm10378F6XQQ1 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm10378F6XQQ1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm10378F6XQQ1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm10378F6XQQ1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm10378F6XQQ1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm10378F6XQQ1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm10378F6XQQ1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm10378F6XQQ1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm10378F6XQQ1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm10378F6XQQ1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm10378F6XQQ1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm10378F6XQQ1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm10378F6XQQ1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm10378F6XQQ1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm10378F6XQQ1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm10378F6XQQ1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm10378F6XQQ1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm10378F6XQQ1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm10378F6XQQ1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm10378F6XQQ1 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm10378F6XQQ1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm10378F6XQQ1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
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