Protein–RNA interactions for Protein: F6U8V3

H2-M11, Histocompatibility 2, M region locus 11 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M11F6U8V3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2-M11F6U8V3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2-M11F6U8V3 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2-M11F6U8V3 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2-M11F6U8V3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2-M11F6U8V3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2-M11F6U8V3 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2-M11F6U8V3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2-M11F6U8V3 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-M11F6U8V3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-M11F6U8V3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-M11F6U8V3 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-M11F6U8V3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-M11F6U8V3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-M11F6U8V3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-M11F6U8V3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-M11F6U8V3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-M11F6U8V3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-M11F6U8V3 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-M11F6U8V3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-M11F6U8V3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-M11F6U8V3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
H2-M11F6U8V3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
H2-M11F6U8V3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-M11F6U8V3 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-M11F6U8V3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-M11F6U8V3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-M11F6U8V3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-M11F6U8V3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-M11F6U8V3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-M11F6U8V3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-M11F6U8V3 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-M11F6U8V3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-M11F6U8V3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-M11F6U8V3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-M11F6U8V3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-M11F6U8V3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-M11F6U8V3 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-M11F6U8V3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-M11F6U8V3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-M11F6U8V3 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-M11F6U8V3 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-M11F6U8V3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-M11F6U8V3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-M11F6U8V3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-M11F6U8V3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-M11F6U8V3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-M11F6U8V3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-M11F6U8V3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-M11F6U8V3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-M11F6U8V3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-M11F6U8V3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-M11F6U8V3 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-M11F6U8V3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-M11F6U8V3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-M11F6U8V3 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-M11F6U8V3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-M11F6U8V3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-M11F6U8V3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-M11F6U8V3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-M11F6U8V3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-M11F6U8V3 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-M11F6U8V3 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-M11F6U8V3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-M11F6U8V3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-M11F6U8V3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-M11F6U8V3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-M11F6U8V3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-M11F6U8V3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-M11F6U8V3 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-M11F6U8V3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2-M11F6U8V3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2-M11F6U8V3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2-M11F6U8V3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2-M11F6U8V3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2-M11F6U8V3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
H2-M11F6U8V3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2-M11F6U8V3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-M11F6U8V3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-M11F6U8V3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-M11F6U8V3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-M11F6U8V3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-M11F6U8V3 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-M11F6U8V3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-M11F6U8V3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-M11F6U8V3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-M11F6U8V3 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-M11F6U8V3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-M11F6U8V3 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-M11F6U8V3 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-M11F6U8V3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
H2-M11F6U8V3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
H2-M11F6U8V3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
H2-M11F6U8V3 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
H2-M11F6U8V3 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
H2-M11F6U8V3 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2-M11F6U8V3 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2-M11F6U8V3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2-M11F6U8V3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2-M11F6U8V3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms