Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lmod3E9QA62 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lmod3E9QA62 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lmod3E9QA62 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lmod3E9QA62 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lmod3E9QA62 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lmod3E9QA62 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lmod3E9QA62 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lmod3E9QA62 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lmod3E9QA62 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lmod3E9QA62 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lmod3E9QA62 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lmod3E9QA62 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lmod3E9QA62 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lmod3E9QA62 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Lmod3E9QA62 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lmod3E9QA62 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lmod3E9QA62 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lmod3E9QA62 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lmod3E9QA62 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lmod3E9QA62 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lmod3E9QA62 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lmod3E9QA62 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lmod3E9QA62 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lmod3E9QA62 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lmod3E9QA62 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lmod3E9QA62 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lmod3E9QA62 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lmod3E9QA62 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Lmod3E9QA62 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lmod3E9QA62 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lmod3E9QA62 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lmod3E9QA62 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lmod3E9QA62 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lmod3E9QA62 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lmod3E9QA62 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lmod3E9QA62 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lmod3E9QA62 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lmod3E9QA62 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lmod3E9QA62 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lmod3E9QA62 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Lmod3E9QA62 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lmod3E9QA62 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lmod3E9QA62 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lmod3E9QA62 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lmod3E9QA62 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lmod3E9QA62 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Lmod3E9QA62 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lmod3E9QA62 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lmod3E9QA62 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lmod3E9QA62 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Lmod3E9QA62 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lmod3E9QA62 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lmod3E9QA62 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lmod3E9QA62 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lmod3E9QA62 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lmod3E9QA62 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lmod3E9QA62 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lmod3E9QA62 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lmod3E9QA62 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lmod3E9QA62 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lmod3E9QA62 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lmod3E9QA62 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lmod3E9QA62 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lmod3E9QA62 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lmod3E9QA62 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lmod3E9QA62 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lmod3E9QA62 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lmod3E9QA62 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lmod3E9QA62 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lmod3E9QA62 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lmod3E9QA62 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lmod3E9QA62 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lmod3E9QA62 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lmod3E9QA62 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lmod3E9QA62 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lmod3E9QA62 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lmod3E9QA62 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lmod3E9QA62 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lmod3E9QA62 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lmod3E9QA62 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lmod3E9QA62 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lmod3E9QA62 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lmod3E9QA62 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lmod3E9QA62 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lmod3E9QA62 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lmod3E9QA62 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lmod3E9QA62 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lmod3E9QA62 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lmod3E9QA62 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lmod3E9QA62 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lmod3E9QA62 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lmod3E9QA62 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lmod3E9QA62 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lmod3E9QA62 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lmod3E9QA62 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lmod3E9QA62 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lmod3E9QA62 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lmod3E9QA62 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lmod3E9QA62 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms