Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7P1

Col22a1, Collagen, type XXII, alpha 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col22a1E9Q7P1 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Col22a1E9Q7P1 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Col22a1E9Q7P1 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Col22a1E9Q7P1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Col22a1E9Q7P1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Col22a1E9Q7P1 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Col22a1E9Q7P1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Col22a1E9Q7P1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Col22a1E9Q7P1 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Col22a1E9Q7P1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Col22a1E9Q7P1 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Col22a1E9Q7P1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Col22a1E9Q7P1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Col22a1E9Q7P1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Col22a1E9Q7P1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Col22a1E9Q7P1 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Col22a1E9Q7P1 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Col22a1E9Q7P1 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Col22a1E9Q7P1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Col22a1E9Q7P1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Col22a1E9Q7P1 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Col22a1E9Q7P1 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Col22a1E9Q7P1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Col22a1E9Q7P1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Col22a1E9Q7P1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Col22a1E9Q7P1 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Col22a1E9Q7P1 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Col22a1E9Q7P1 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Col22a1E9Q7P1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Col22a1E9Q7P1 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Col22a1E9Q7P1 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Col22a1E9Q7P1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Col22a1E9Q7P1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Col22a1E9Q7P1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Col22a1E9Q7P1 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Col22a1E9Q7P1 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Col22a1E9Q7P1 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Col22a1E9Q7P1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Col22a1E9Q7P1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Col22a1E9Q7P1 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Col22a1E9Q7P1 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Col22a1E9Q7P1 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Col22a1E9Q7P1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Col22a1E9Q7P1 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Col22a1E9Q7P1 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Col22a1E9Q7P1 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Col22a1E9Q7P1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Col22a1E9Q7P1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Col22a1E9Q7P1 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Col22a1E9Q7P1 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Col22a1E9Q7P1 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Col22a1E9Q7P1 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Col22a1E9Q7P1 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Col22a1E9Q7P1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Col22a1E9Q7P1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Col22a1E9Q7P1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Col22a1E9Q7P1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Col22a1E9Q7P1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Col22a1E9Q7P1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Col22a1E9Q7P1 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Col22a1E9Q7P1 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Col22a1E9Q7P1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Col22a1E9Q7P1 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Col22a1E9Q7P1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Col22a1E9Q7P1 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Col22a1E9Q7P1 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Col22a1E9Q7P1 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Col22a1E9Q7P1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Col22a1E9Q7P1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Col22a1E9Q7P1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Col22a1E9Q7P1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Col22a1E9Q7P1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Col22a1E9Q7P1 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Col22a1E9Q7P1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Col22a1E9Q7P1 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Col22a1E9Q7P1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Col22a1E9Q7P1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Col22a1E9Q7P1 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Col22a1E9Q7P1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Col22a1E9Q7P1 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Col22a1E9Q7P1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Col22a1E9Q7P1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Col22a1E9Q7P1 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Col22a1E9Q7P1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Col22a1E9Q7P1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Col22a1E9Q7P1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Col22a1E9Q7P1 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Col22a1E9Q7P1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Col22a1E9Q7P1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Col22a1E9Q7P1 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Col22a1E9Q7P1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Col22a1E9Q7P1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Col22a1E9Q7P1 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Col22a1E9Q7P1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Col22a1E9Q7P1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Col22a1E9Q7P1 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Col22a1E9Q7P1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Col22a1E9Q7P1 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Col22a1E9Q7P1 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Col22a1E9Q7P1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms