Protein–RNA interactions for Protein: E9Q557

Dsp, Desmoplakin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DspE9Q557 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DspE9Q557 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DspE9Q557 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DspE9Q557 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DspE9Q557 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DspE9Q557 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DspE9Q557 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DspE9Q557 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DspE9Q557 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DspE9Q557 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DspE9Q557 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DspE9Q557 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DspE9Q557 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DspE9Q557 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DspE9Q557 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DspE9Q557 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
DspE9Q557 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
DspE9Q557 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DspE9Q557 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DspE9Q557 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DspE9Q557 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DspE9Q557 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DspE9Q557 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DspE9Q557 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DspE9Q557 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DspE9Q557 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DspE9Q557 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DspE9Q557 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DspE9Q557 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
DspE9Q557 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DspE9Q557 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
DspE9Q557 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DspE9Q557 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DspE9Q557 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
DspE9Q557 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DspE9Q557 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DspE9Q557 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DspE9Q557 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DspE9Q557 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
DspE9Q557 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DspE9Q557 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DspE9Q557 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DspE9Q557 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DspE9Q557 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DspE9Q557 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DspE9Q557 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DspE9Q557 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DspE9Q557 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DspE9Q557 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
DspE9Q557 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DspE9Q557 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DspE9Q557 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DspE9Q557 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DspE9Q557 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DspE9Q557 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DspE9Q557 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DspE9Q557 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
DspE9Q557 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DspE9Q557 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DspE9Q557 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DspE9Q557 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DspE9Q557 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DspE9Q557 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DspE9Q557 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
DspE9Q557 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DspE9Q557 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DspE9Q557 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DspE9Q557 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DspE9Q557 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DspE9Q557 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DspE9Q557 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DspE9Q557 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DspE9Q557 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DspE9Q557 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DspE9Q557 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DspE9Q557 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DspE9Q557 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DspE9Q557 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DspE9Q557 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
DspE9Q557 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DspE9Q557 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DspE9Q557 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DspE9Q557 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DspE9Q557 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DspE9Q557 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DspE9Q557 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DspE9Q557 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DspE9Q557 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
DspE9Q557 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
DspE9Q557 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DspE9Q557 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
DspE9Q557 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DspE9Q557 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DspE9Q557 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DspE9Q557 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DspE9Q557 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DspE9Q557 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DspE9Q557 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DspE9Q557 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
DspE9Q557 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms