Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm20518E9Q548 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm20518E9Q548 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm20518E9Q548 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm20518E9Q548 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm20518E9Q548 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm20518E9Q548 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm20518E9Q548 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm20518E9Q548 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm20518E9Q548 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm20518E9Q548 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm20518E9Q548 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm20518E9Q548 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm20518E9Q548 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm20518E9Q548 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm20518E9Q548 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm20518E9Q548 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm20518E9Q548 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm20518E9Q548 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm20518E9Q548 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm20518E9Q548 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm20518E9Q548 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm20518E9Q548 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm20518E9Q548 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm20518E9Q548 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm20518E9Q548 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm20518E9Q548 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm20518E9Q548 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm20518E9Q548 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm20518E9Q548 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm20518E9Q548 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm20518E9Q548 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm20518E9Q548 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm20518E9Q548 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm20518E9Q548 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm20518E9Q548 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm20518E9Q548 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm20518E9Q548 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm20518E9Q548 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm20518E9Q548 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm20518E9Q548 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm20518E9Q548 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm20518E9Q548 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm20518E9Q548 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm20518E9Q548 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm20518E9Q548 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm20518E9Q548 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm20518E9Q548 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm20518E9Q548 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm20518E9Q548 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm20518E9Q548 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm20518E9Q548 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm20518E9Q548 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm20518E9Q548 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm20518E9Q548 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm20518E9Q548 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm20518E9Q548 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm20518E9Q548 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm20518E9Q548 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm20518E9Q548 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm20518E9Q548 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm20518E9Q548 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm20518E9Q548 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm20518E9Q548 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm20518E9Q548 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm20518E9Q548 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm20518E9Q548 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm20518E9Q548 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm20518E9Q548 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm20518E9Q548 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm20518E9Q548 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm20518E9Q548 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm20518E9Q548 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm20518E9Q548 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm20518E9Q548 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm20518E9Q548 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm20518E9Q548 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm20518E9Q548 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm20518E9Q548 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm20518E9Q548 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm20518E9Q548 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm20518E9Q548 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm20518E9Q548 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm20518E9Q548 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm20518E9Q548 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm20518E9Q548 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm20518E9Q548 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm20518E9Q548 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm20518E9Q548 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm20518E9Q548 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm20518E9Q548 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm20518E9Q548 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm20518E9Q548 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm20518E9Q548 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm20518E9Q548 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm20518E9Q548 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm20518E9Q548 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm20518E9Q548 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm20518E9Q548 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm20518E9Q548 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms