Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2E9

Krtap11-1, Keratin-associated protein 11-1, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap11-1E9Q2E9 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krtap11-1E9Q2E9 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krtap11-1E9Q2E9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Krtap11-1E9Q2E9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krtap11-1E9Q2E9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krtap11-1E9Q2E9 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Krtap11-1E9Q2E9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krtap11-1E9Q2E9 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krtap11-1E9Q2E9 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krtap11-1E9Q2E9 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krtap11-1E9Q2E9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krtap11-1E9Q2E9 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krtap11-1E9Q2E9 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krtap11-1E9Q2E9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krtap11-1E9Q2E9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krtap11-1E9Q2E9 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krtap11-1E9Q2E9 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krtap11-1E9Q2E9 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krtap11-1E9Q2E9 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krtap11-1E9Q2E9 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krtap11-1E9Q2E9 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krtap11-1E9Q2E9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krtap11-1E9Q2E9 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krtap11-1E9Q2E9 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Krtap11-1E9Q2E9 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Krtap11-1E9Q2E9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krtap11-1E9Q2E9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krtap11-1E9Q2E9 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krtap11-1E9Q2E9 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krtap11-1E9Q2E9 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krtap11-1E9Q2E9 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krtap11-1E9Q2E9 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krtap11-1E9Q2E9 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krtap11-1E9Q2E9 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krtap11-1E9Q2E9 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krtap11-1E9Q2E9 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krtap11-1E9Q2E9 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Krtap11-1E9Q2E9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krtap11-1E9Q2E9 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krtap11-1E9Q2E9 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krtap11-1E9Q2E9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krtap11-1E9Q2E9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krtap11-1E9Q2E9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krtap11-1E9Q2E9 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krtap11-1E9Q2E9 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krtap11-1E9Q2E9 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krtap11-1E9Q2E9 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krtap11-1E9Q2E9 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krtap11-1E9Q2E9 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krtap11-1E9Q2E9 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krtap11-1E9Q2E9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krtap11-1E9Q2E9 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krtap11-1E9Q2E9 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krtap11-1E9Q2E9 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Krtap11-1E9Q2E9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Krtap11-1E9Q2E9 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Krtap11-1E9Q2E9 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Krtap11-1E9Q2E9 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Krtap11-1E9Q2E9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Krtap11-1E9Q2E9 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Krtap11-1E9Q2E9 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Krtap11-1E9Q2E9 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Krtap11-1E9Q2E9 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Krtap11-1E9Q2E9 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Krtap11-1E9Q2E9 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Krtap11-1E9Q2E9 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Krtap11-1E9Q2E9 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Krtap11-1E9Q2E9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Krtap11-1E9Q2E9 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Krtap11-1E9Q2E9 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Krtap11-1E9Q2E9 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Krtap11-1E9Q2E9 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Krtap11-1E9Q2E9 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Krtap11-1E9Q2E9 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Krtap11-1E9Q2E9 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Krtap11-1E9Q2E9 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Krtap11-1E9Q2E9 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Krtap11-1E9Q2E9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Krtap11-1E9Q2E9 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Krtap11-1E9Q2E9 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Krtap11-1E9Q2E9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Krtap11-1E9Q2E9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Krtap11-1E9Q2E9 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Krtap11-1E9Q2E9 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Krtap11-1E9Q2E9 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Krtap11-1E9Q2E9 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Krtap11-1E9Q2E9 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Krtap11-1E9Q2E9 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Krtap11-1E9Q2E9 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Krtap11-1E9Q2E9 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Krtap11-1E9Q2E9 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Krtap11-1E9Q2E9 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Krtap11-1E9Q2E9 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Krtap11-1E9Q2E9 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Krtap11-1E9Q2E9 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Krtap11-1E9Q2E9 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Krtap11-1E9Q2E9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Krtap11-1E9Q2E9 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Krtap11-1E9Q2E9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Krtap11-1E9Q2E9 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms