Protein–RNA interactions for Protein: E9Q053

Gm9972, Predicted gene 9972, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9972E9Q053 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm9972E9Q053 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm9972E9Q053 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm9972E9Q053 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm9972E9Q053 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm9972E9Q053 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm9972E9Q053 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm9972E9Q053 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm9972E9Q053 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm9972E9Q053 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm9972E9Q053 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm9972E9Q053 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm9972E9Q053 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm9972E9Q053 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm9972E9Q053 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm9972E9Q053 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm9972E9Q053 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm9972E9Q053 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm9972E9Q053 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm9972E9Q053 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm9972E9Q053 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm9972E9Q053 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm9972E9Q053 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm9972E9Q053 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm9972E9Q053 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm9972E9Q053 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm9972E9Q053 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm9972E9Q053 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm9972E9Q053 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm9972E9Q053 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm9972E9Q053 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm9972E9Q053 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Gm9972E9Q053 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm9972E9Q053 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm9972E9Q053 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm9972E9Q053 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm9972E9Q053 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm9972E9Q053 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm9972E9Q053 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm9972E9Q053 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm9972E9Q053 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm9972E9Q053 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm9972E9Q053 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm9972E9Q053 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm9972E9Q053 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm9972E9Q053 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm9972E9Q053 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm9972E9Q053 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm9972E9Q053 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm9972E9Q053 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm9972E9Q053 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm9972E9Q053 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm9972E9Q053 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm9972E9Q053 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm9972E9Q053 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm9972E9Q053 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm9972E9Q053 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm9972E9Q053 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm9972E9Q053 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm9972E9Q053 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm9972E9Q053 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm9972E9Q053 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm9972E9Q053 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm9972E9Q053 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm9972E9Q053 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm9972E9Q053 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm9972E9Q053 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm9972E9Q053 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm9972E9Q053 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm9972E9Q053 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm9972E9Q053 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm9972E9Q053 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm9972E9Q053 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm9972E9Q053 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm9972E9Q053 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm9972E9Q053 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm9972E9Q053 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm9972E9Q053 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm9972E9Q053 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm9972E9Q053 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm9972E9Q053 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm9972E9Q053 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm9972E9Q053 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm9972E9Q053 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm9972E9Q053 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm9972E9Q053 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm9972E9Q053 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm9972E9Q053 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm9972E9Q053 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm9972E9Q053 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm9972E9Q053 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm9972E9Q053 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm9972E9Q053 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm9972E9Q053 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm9972E9Q053 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm9972E9Q053 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm9972E9Q053 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm9972E9Q053 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm9972E9Q053 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm9972E9Q053 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms