Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM7

Scaf11, SR-related CTD-associated factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf11E9PZM7 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Scaf11E9PZM7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Scaf11E9PZM7 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Scaf11E9PZM7 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Scaf11E9PZM7 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Scaf11E9PZM7 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Scaf11E9PZM7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Scaf11E9PZM7 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Scaf11E9PZM7 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Scaf11E9PZM7 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Scaf11E9PZM7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Scaf11E9PZM7 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Scaf11E9PZM7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Scaf11E9PZM7 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Scaf11E9PZM7 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Scaf11E9PZM7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Scaf11E9PZM7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Scaf11E9PZM7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Scaf11E9PZM7 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Scaf11E9PZM7 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Scaf11E9PZM7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Scaf11E9PZM7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Scaf11E9PZM7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Scaf11E9PZM7 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Scaf11E9PZM7 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Scaf11E9PZM7 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Scaf11E9PZM7 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Scaf11E9PZM7 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Scaf11E9PZM7 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Scaf11E9PZM7 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Scaf11E9PZM7 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Scaf11E9PZM7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Scaf11E9PZM7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Scaf11E9PZM7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Scaf11E9PZM7 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Scaf11E9PZM7 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Scaf11E9PZM7 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Scaf11E9PZM7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Scaf11E9PZM7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Scaf11E9PZM7 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Scaf11E9PZM7 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Scaf11E9PZM7 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Scaf11E9PZM7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Scaf11E9PZM7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Scaf11E9PZM7 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Scaf11E9PZM7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Scaf11E9PZM7 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Scaf11E9PZM7 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Scaf11E9PZM7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Scaf11E9PZM7 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Scaf11E9PZM7 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Scaf11E9PZM7 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Scaf11E9PZM7 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Scaf11E9PZM7 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Scaf11E9PZM7 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Scaf11E9PZM7 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Scaf11E9PZM7 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Scaf11E9PZM7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Scaf11E9PZM7 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Scaf11E9PZM7 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Scaf11E9PZM7 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Scaf11E9PZM7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Scaf11E9PZM7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Scaf11E9PZM7 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Scaf11E9PZM7 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Scaf11E9PZM7 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Scaf11E9PZM7 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Scaf11E9PZM7 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Scaf11E9PZM7 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Scaf11E9PZM7 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Scaf11E9PZM7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Scaf11E9PZM7 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Scaf11E9PZM7 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Scaf11E9PZM7 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Scaf11E9PZM7 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Scaf11E9PZM7 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Scaf11E9PZM7 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Scaf11E9PZM7 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Scaf11E9PZM7 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Scaf11E9PZM7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Scaf11E9PZM7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Scaf11E9PZM7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Scaf11E9PZM7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Scaf11E9PZM7 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Scaf11E9PZM7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Scaf11E9PZM7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Scaf11E9PZM7 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Scaf11E9PZM7 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Scaf11E9PZM7 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Scaf11E9PZM7 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Scaf11E9PZM7 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Scaf11E9PZM7 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Scaf11E9PZM7 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Scaf11E9PZM7 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Scaf11E9PZM7 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Scaf11E9PZM7 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Scaf11E9PZM7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Scaf11E9PZM7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Scaf11E9PZM7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Scaf11E9PZM7 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms