Protein–RNA interactions for Protein: E9PV98

Trim5, Tripartite motif-containing 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim5E9PV98 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim5E9PV98 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim5E9PV98 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim5E9PV98 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim5E9PV98 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim5E9PV98 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim5E9PV98 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim5E9PV98 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim5E9PV98 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim5E9PV98 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim5E9PV98 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim5E9PV98 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim5E9PV98 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim5E9PV98 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim5E9PV98 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim5E9PV98 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim5E9PV98 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim5E9PV98 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Trim5E9PV98 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim5E9PV98 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim5E9PV98 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim5E9PV98 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim5E9PV98 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim5E9PV98 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim5E9PV98 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim5E9PV98 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim5E9PV98 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim5E9PV98 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim5E9PV98 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim5E9PV98 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim5E9PV98 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim5E9PV98 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim5E9PV98 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim5E9PV98 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim5E9PV98 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim5E9PV98 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim5E9PV98 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim5E9PV98 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim5E9PV98 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim5E9PV98 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim5E9PV98 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim5E9PV98 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim5E9PV98 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim5E9PV98 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim5E9PV98 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim5E9PV98 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim5E9PV98 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim5E9PV98 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim5E9PV98 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim5E9PV98 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim5E9PV98 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim5E9PV98 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim5E9PV98 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim5E9PV98 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim5E9PV98 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim5E9PV98 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim5E9PV98 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim5E9PV98 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim5E9PV98 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim5E9PV98 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim5E9PV98 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim5E9PV98 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim5E9PV98 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim5E9PV98 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim5E9PV98 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim5E9PV98 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim5E9PV98 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim5E9PV98 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim5E9PV98 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim5E9PV98 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim5E9PV98 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim5E9PV98 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim5E9PV98 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim5E9PV98 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim5E9PV98 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim5E9PV98 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim5E9PV98 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim5E9PV98 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim5E9PV98 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim5E9PV98 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim5E9PV98 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim5E9PV98 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim5E9PV98 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim5E9PV98 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim5E9PV98 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim5E9PV98 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim5E9PV98 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim5E9PV98 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim5E9PV98 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim5E9PV98 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim5E9PV98 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim5E9PV98 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim5E9PV98 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim5E9PV98 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim5E9PV98 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim5E9PV98 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim5E9PV98 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim5E9PV98 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim5E9PV98 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim5E9PV98 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms