Protein–RNA interactions for Protein: D3Z4U6

Gm5934, Predicted gene 5934, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5934D3Z4U6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm5934D3Z4U6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm5934D3Z4U6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm5934D3Z4U6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm5934D3Z4U6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm5934D3Z4U6 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm5934D3Z4U6 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm5934D3Z4U6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm5934D3Z4U6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm5934D3Z4U6 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm5934D3Z4U6 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm5934D3Z4U6 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm5934D3Z4U6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm5934D3Z4U6 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm5934D3Z4U6 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm5934D3Z4U6 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm5934D3Z4U6 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm5934D3Z4U6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm5934D3Z4U6 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm5934D3Z4U6 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm5934D3Z4U6 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm5934D3Z4U6 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm5934D3Z4U6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm5934D3Z4U6 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm5934D3Z4U6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm5934D3Z4U6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm5934D3Z4U6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm5934D3Z4U6 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm5934D3Z4U6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm5934D3Z4U6 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm5934D3Z4U6 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Gm5934D3Z4U6 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm5934D3Z4U6 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm5934D3Z4U6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm5934D3Z4U6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm5934D3Z4U6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm5934D3Z4U6 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm5934D3Z4U6 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm5934D3Z4U6 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm5934D3Z4U6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm5934D3Z4U6 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm5934D3Z4U6 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm5934D3Z4U6 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm5934D3Z4U6 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm5934D3Z4U6 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm5934D3Z4U6 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm5934D3Z4U6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm5934D3Z4U6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm5934D3Z4U6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm5934D3Z4U6 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm5934D3Z4U6 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm5934D3Z4U6 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm5934D3Z4U6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm5934D3Z4U6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm5934D3Z4U6 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm5934D3Z4U6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm5934D3Z4U6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm5934D3Z4U6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm5934D3Z4U6 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm5934D3Z4U6 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm5934D3Z4U6 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm5934D3Z4U6 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm5934D3Z4U6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm5934D3Z4U6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm5934D3Z4U6 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm5934D3Z4U6 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm5934D3Z4U6 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm5934D3Z4U6 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm5934D3Z4U6 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm5934D3Z4U6 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm5934D3Z4U6 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm5934D3Z4U6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm5934D3Z4U6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm5934D3Z4U6 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm5934D3Z4U6 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm5934D3Z4U6 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Gm5934D3Z4U6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Gm5934D3Z4U6 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm5934D3Z4U6 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm5934D3Z4U6 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm5934D3Z4U6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm5934D3Z4U6 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm5934D3Z4U6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm5934D3Z4U6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm5934D3Z4U6 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm5934D3Z4U6 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm5934D3Z4U6 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm5934D3Z4U6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm5934D3Z4U6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm5934D3Z4U6 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm5934D3Z4U6 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm5934D3Z4U6 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm5934D3Z4U6 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm5934D3Z4U6 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm5934D3Z4U6 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm5934D3Z4U6 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm5934D3Z4U6 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm5934D3Z4U6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm5934D3Z4U6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm5934D3Z4U6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms