Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms