Protein–RNA interactions for Protein: D3YZV8

Ccdc8, Coiled-coil domain-containing protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc8D3YZV8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc8D3YZV8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc8D3YZV8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc8D3YZV8 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc8D3YZV8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc8D3YZV8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc8D3YZV8 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc8D3YZV8 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc8D3YZV8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc8D3YZV8 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc8D3YZV8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc8D3YZV8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc8D3YZV8 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc8D3YZV8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc8D3YZV8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc8D3YZV8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc8D3YZV8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc8D3YZV8 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc8D3YZV8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc8D3YZV8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc8D3YZV8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc8D3YZV8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc8D3YZV8 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc8D3YZV8 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc8D3YZV8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc8D3YZV8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc8D3YZV8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc8D3YZV8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc8D3YZV8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc8D3YZV8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc8D3YZV8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc8D3YZV8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc8D3YZV8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc8D3YZV8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc8D3YZV8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc8D3YZV8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc8D3YZV8 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc8D3YZV8 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc8D3YZV8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc8D3YZV8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc8D3YZV8 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc8D3YZV8 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc8D3YZV8 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc8D3YZV8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc8D3YZV8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc8D3YZV8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc8D3YZV8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc8D3YZV8 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc8D3YZV8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc8D3YZV8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc8D3YZV8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc8D3YZV8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc8D3YZV8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc8D3YZV8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc8D3YZV8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc8D3YZV8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc8D3YZV8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc8D3YZV8 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc8D3YZV8 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc8D3YZV8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc8D3YZV8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc8D3YZV8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ccdc8D3YZV8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc8D3YZV8 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc8D3YZV8 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc8D3YZV8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc8D3YZV8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc8D3YZV8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc8D3YZV8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc8D3YZV8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc8D3YZV8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc8D3YZV8 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc8D3YZV8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc8D3YZV8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc8D3YZV8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc8D3YZV8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc8D3YZV8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc8D3YZV8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc8D3YZV8 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc8D3YZV8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc8D3YZV8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc8D3YZV8 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc8D3YZV8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc8D3YZV8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc8D3YZV8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc8D3YZV8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc8D3YZV8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc8D3YZV8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc8D3YZV8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc8D3YZV8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc8D3YZV8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc8D3YZV8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc8D3YZV8 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc8D3YZV8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc8D3YZV8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc8D3YZV8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc8D3YZV8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc8D3YZV8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc8D3YZV8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc8D3YZV8 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 573.2 ms