Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf217D3YYI7 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf217D3YYI7 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf217D3YYI7 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf217D3YYI7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf217D3YYI7 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf217D3YYI7 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf217D3YYI7 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf217D3YYI7 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf217D3YYI7 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf217D3YYI7 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf217D3YYI7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf217D3YYI7 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf217D3YYI7 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf217D3YYI7 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf217D3YYI7 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf217D3YYI7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf217D3YYI7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf217D3YYI7 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf217D3YYI7 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf217D3YYI7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf217D3YYI7 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf217D3YYI7 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf217D3YYI7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf217D3YYI7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf217D3YYI7 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf217D3YYI7 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf217D3YYI7 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf217D3YYI7 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf217D3YYI7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf217D3YYI7 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf217D3YYI7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf217D3YYI7 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf217D3YYI7 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf217D3YYI7 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf217D3YYI7 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf217D3YYI7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf217D3YYI7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf217D3YYI7 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf217D3YYI7 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf217D3YYI7 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf217D3YYI7 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf217D3YYI7 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf217D3YYI7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf217D3YYI7 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf217D3YYI7 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf217D3YYI7 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf217D3YYI7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf217D3YYI7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf217D3YYI7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf217D3YYI7 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rnf217D3YYI7 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf217D3YYI7 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf217D3YYI7 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf217D3YYI7 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf217D3YYI7 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf217D3YYI7 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf217D3YYI7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf217D3YYI7 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf217D3YYI7 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf217D3YYI7 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf217D3YYI7 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf217D3YYI7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf217D3YYI7 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf217D3YYI7 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf217D3YYI7 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf217D3YYI7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf217D3YYI7 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf217D3YYI7 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf217D3YYI7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf217D3YYI7 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf217D3YYI7 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf217D3YYI7 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf217D3YYI7 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf217D3YYI7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf217D3YYI7 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf217D3YYI7 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf217D3YYI7 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf217D3YYI7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf217D3YYI7 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf217D3YYI7 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf217D3YYI7 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf217D3YYI7 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf217D3YYI7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf217D3YYI7 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf217D3YYI7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf217D3YYI7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf217D3YYI7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf217D3YYI7 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf217D3YYI7 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf217D3YYI7 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf217D3YYI7 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnf217D3YYI7 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnf217D3YYI7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnf217D3YYI7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnf217D3YYI7 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnf217D3YYI7 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnf217D3YYI7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnf217D3YYI7 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnf217D3YYI7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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