Protein–RNA interactions for Protein: B7XG49

Fam71a, Family with sequence similarity 71, member A, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71aB7XG49 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam71aB7XG49 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam71aB7XG49 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam71aB7XG49 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam71aB7XG49 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam71aB7XG49 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam71aB7XG49 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam71aB7XG49 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam71aB7XG49 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam71aB7XG49 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam71aB7XG49 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam71aB7XG49 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam71aB7XG49 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam71aB7XG49 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Fam71aB7XG49 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam71aB7XG49 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam71aB7XG49 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam71aB7XG49 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam71aB7XG49 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam71aB7XG49 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam71aB7XG49 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam71aB7XG49 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam71aB7XG49 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam71aB7XG49 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam71aB7XG49 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam71aB7XG49 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam71aB7XG49 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam71aB7XG49 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam71aB7XG49 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam71aB7XG49 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam71aB7XG49 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam71aB7XG49 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam71aB7XG49 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam71aB7XG49 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam71aB7XG49 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam71aB7XG49 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam71aB7XG49 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam71aB7XG49 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam71aB7XG49 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam71aB7XG49 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam71aB7XG49 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam71aB7XG49 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam71aB7XG49 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam71aB7XG49 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam71aB7XG49 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam71aB7XG49 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam71aB7XG49 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam71aB7XG49 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam71aB7XG49 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam71aB7XG49 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam71aB7XG49 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam71aB7XG49 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam71aB7XG49 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam71aB7XG49 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam71aB7XG49 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam71aB7XG49 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam71aB7XG49 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam71aB7XG49 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam71aB7XG49 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam71aB7XG49 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam71aB7XG49 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam71aB7XG49 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Fam71aB7XG49 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Fam71aB7XG49 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Fam71aB7XG49 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fam71aB7XG49 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fam71aB7XG49 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam71aB7XG49 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam71aB7XG49 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam71aB7XG49 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam71aB7XG49 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam71aB7XG49 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam71aB7XG49 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam71aB7XG49 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam71aB7XG49 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam71aB7XG49 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam71aB7XG49 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam71aB7XG49 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam71aB7XG49 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam71aB7XG49 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam71aB7XG49 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam71aB7XG49 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam71aB7XG49 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam71aB7XG49 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam71aB7XG49 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam71aB7XG49 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam71aB7XG49 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam71aB7XG49 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam71aB7XG49 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam71aB7XG49 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam71aB7XG49 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam71aB7XG49 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam71aB7XG49 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam71aB7XG49 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam71aB7XG49 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam71aB7XG49 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam71aB7XG49 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam71aB7XG49 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam71aB7XG49 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam71aB7XG49 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms