Protein–RNA interactions for Protein: B2RXQ2

Ppfia1, Ppfia1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia1B2RXQ2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ppfia1B2RXQ2 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ppfia1B2RXQ2 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ppfia1B2RXQ2 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ppfia1B2RXQ2 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ppfia1B2RXQ2 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ppfia1B2RXQ2 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ppfia1B2RXQ2 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ppfia1B2RXQ2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ppfia1B2RXQ2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ppfia1B2RXQ2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ppfia1B2RXQ2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Ppfia1B2RXQ2 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Ppfia1B2RXQ2 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Ppfia1B2RXQ2 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ppfia1B2RXQ2 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ppfia1B2RXQ2 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ppfia1B2RXQ2 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ppfia1B2RXQ2 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ppfia1B2RXQ2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ppfia1B2RXQ2 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ppfia1B2RXQ2 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ppfia1B2RXQ2 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ppfia1B2RXQ2 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ppfia1B2RXQ2 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ppfia1B2RXQ2 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ppfia1B2RXQ2 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ppfia1B2RXQ2 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Ppfia1B2RXQ2 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ppfia1B2RXQ2 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ppfia1B2RXQ2 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ppfia1B2RXQ2 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ppfia1B2RXQ2 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ppfia1B2RXQ2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ppfia1B2RXQ2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ppfia1B2RXQ2 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ppfia1B2RXQ2 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ppfia1B2RXQ2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ppfia1B2RXQ2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppfia1B2RXQ2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppfia1B2RXQ2 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppfia1B2RXQ2 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppfia1B2RXQ2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppfia1B2RXQ2 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppfia1B2RXQ2 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ppfia1B2RXQ2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ppfia1B2RXQ2 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ppfia1B2RXQ2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ppfia1B2RXQ2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ppfia1B2RXQ2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ppfia1B2RXQ2 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ppfia1B2RXQ2 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ppfia1B2RXQ2 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ppfia1B2RXQ2 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ppfia1B2RXQ2 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ppfia1B2RXQ2 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ppfia1B2RXQ2 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ppfia1B2RXQ2 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ppfia1B2RXQ2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ppfia1B2RXQ2 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ppfia1B2RXQ2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ppfia1B2RXQ2 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ppfia1B2RXQ2 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ppfia1B2RXQ2 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ppfia1B2RXQ2 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ppfia1B2RXQ2 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ppfia1B2RXQ2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ppfia1B2RXQ2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ppfia1B2RXQ2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ppfia1B2RXQ2 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ppfia1B2RXQ2 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ppfia1B2RXQ2 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ppfia1B2RXQ2 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ppfia1B2RXQ2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ppfia1B2RXQ2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ppfia1B2RXQ2 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ppfia1B2RXQ2 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ppfia1B2RXQ2 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ppfia1B2RXQ2 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ppfia1B2RXQ2 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ppfia1B2RXQ2 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ppfia1B2RXQ2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ppfia1B2RXQ2 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ppfia1B2RXQ2 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ppfia1B2RXQ2 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ppfia1B2RXQ2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ppfia1B2RXQ2 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ppfia1B2RXQ2 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ppfia1B2RXQ2 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ppfia1B2RXQ2 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ppfia1B2RXQ2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ppfia1B2RXQ2 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ppfia1B2RXQ2 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ppfia1B2RXQ2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ppfia1B2RXQ2 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ppfia1B2RXQ2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ppfia1B2RXQ2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ppfia1B2RXQ2 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ppfia1B2RXQ2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ppfia1B2RXQ2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms