Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rd3lB2RV38 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rd3lB2RV38 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rd3lB2RV38 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rd3lB2RV38 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rd3lB2RV38 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rd3lB2RV38 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rd3lB2RV38 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rd3lB2RV38 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rd3lB2RV38 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rd3lB2RV38 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rd3lB2RV38 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Rd3lB2RV38 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rd3lB2RV38 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rd3lB2RV38 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rd3lB2RV38 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rd3lB2RV38 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rd3lB2RV38 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rd3lB2RV38 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rd3lB2RV38 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rd3lB2RV38 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rd3lB2RV38 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rd3lB2RV38 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rd3lB2RV38 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rd3lB2RV38 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rd3lB2RV38 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rd3lB2RV38 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rd3lB2RV38 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rd3lB2RV38 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rd3lB2RV38 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rd3lB2RV38 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rd3lB2RV38 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rd3lB2RV38 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rd3lB2RV38 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rd3lB2RV38 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rd3lB2RV38 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rd3lB2RV38 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rd3lB2RV38 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rd3lB2RV38 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rd3lB2RV38 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rd3lB2RV38 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rd3lB2RV38 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rd3lB2RV38 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rd3lB2RV38 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rd3lB2RV38 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rd3lB2RV38 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rd3lB2RV38 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rd3lB2RV38 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Rd3lB2RV38 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rd3lB2RV38 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rd3lB2RV38 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rd3lB2RV38 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rd3lB2RV38 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rd3lB2RV38 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rd3lB2RV38 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rd3lB2RV38 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rd3lB2RV38 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rd3lB2RV38 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rd3lB2RV38 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rd3lB2RV38 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rd3lB2RV38 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rd3lB2RV38 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rd3lB2RV38 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rd3lB2RV38 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rd3lB2RV38 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rd3lB2RV38 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rd3lB2RV38 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rd3lB2RV38 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rd3lB2RV38 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rd3lB2RV38 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rd3lB2RV38 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rd3lB2RV38 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rd3lB2RV38 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rd3lB2RV38 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rd3lB2RV38 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rd3lB2RV38 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rd3lB2RV38 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rd3lB2RV38 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rd3lB2RV38 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rd3lB2RV38 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rd3lB2RV38 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rd3lB2RV38 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rd3lB2RV38 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rd3lB2RV38 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rd3lB2RV38 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rd3lB2RV38 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rd3lB2RV38 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rd3lB2RV38 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rd3lB2RV38 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rd3lB2RV38 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rd3lB2RV38 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rd3lB2RV38 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rd3lB2RV38 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rd3lB2RV38 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rd3lB2RV38 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rd3lB2RV38 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rd3lB2RV38 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rd3lB2RV38 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rd3lB2RV38 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rd3lB2RV38 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms