Protein–RNA interactions for Protein: B1B0V2

AU022751, Expressed sequence AU022751, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU022751B1B0V2 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
AU022751B1B0V2 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
AU022751B1B0V2 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
AU022751B1B0V2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
AU022751B1B0V2 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
AU022751B1B0V2 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
AU022751B1B0V2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
AU022751B1B0V2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
AU022751B1B0V2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
AU022751B1B0V2 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
AU022751B1B0V2 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
AU022751B1B0V2 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
AU022751B1B0V2 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
AU022751B1B0V2 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
AU022751B1B0V2 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
AU022751B1B0V2 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
AU022751B1B0V2 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
AU022751B1B0V2 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
AU022751B1B0V2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
AU022751B1B0V2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
AU022751B1B0V2 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
AU022751B1B0V2 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
AU022751B1B0V2 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
AU022751B1B0V2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
AU022751B1B0V2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
AU022751B1B0V2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
AU022751B1B0V2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
AU022751B1B0V2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
AU022751B1B0V2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
AU022751B1B0V2 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
AU022751B1B0V2 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
AU022751B1B0V2 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
AU022751B1B0V2 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
AU022751B1B0V2 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
AU022751B1B0V2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
AU022751B1B0V2 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
AU022751B1B0V2 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
AU022751B1B0V2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
AU022751B1B0V2 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
AU022751B1B0V2 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
AU022751B1B0V2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
AU022751B1B0V2 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
AU022751B1B0V2 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
AU022751B1B0V2 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
AU022751B1B0V2 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
AU022751B1B0V2 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
AU022751B1B0V2 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
AU022751B1B0V2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
AU022751B1B0V2 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
AU022751B1B0V2 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
AU022751B1B0V2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
AU022751B1B0V2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
AU022751B1B0V2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
AU022751B1B0V2 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
AU022751B1B0V2 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
AU022751B1B0V2 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
AU022751B1B0V2 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
AU022751B1B0V2 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
AU022751B1B0V2 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
AU022751B1B0V2 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
AU022751B1B0V2 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
AU022751B1B0V2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
AU022751B1B0V2 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
AU022751B1B0V2 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
AU022751B1B0V2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
AU022751B1B0V2 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
AU022751B1B0V2 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
AU022751B1B0V2 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
AU022751B1B0V2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
AU022751B1B0V2 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
AU022751B1B0V2 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
AU022751B1B0V2 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
AU022751B1B0V2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
AU022751B1B0V2 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
AU022751B1B0V2 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
AU022751B1B0V2 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
AU022751B1B0V2 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
AU022751B1B0V2 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
AU022751B1B0V2 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
AU022751B1B0V2 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
AU022751B1B0V2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
AU022751B1B0V2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
AU022751B1B0V2 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
AU022751B1B0V2 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
AU022751B1B0V2 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
AU022751B1B0V2 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
AU022751B1B0V2 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
AU022751B1B0V2 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
AU022751B1B0V2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
AU022751B1B0V2 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
AU022751B1B0V2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
AU022751B1B0V2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
AU022751B1B0V2 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
AU022751B1B0V2 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
AU022751B1B0V2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
AU022751B1B0V2 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
AU022751B1B0V2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
AU022751B1B0V2 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
AU022751B1B0V2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
AU022751B1B0V2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms