Protein–RNA interactions for Protein: A7XUX6

Skint2, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint2A7XUX6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Skint2A7XUX6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Skint2A7XUX6 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Skint2A7XUX6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Skint2A7XUX6 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Skint2A7XUX6 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Skint2A7XUX6 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Skint2A7XUX6 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Skint2A7XUX6 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Skint2A7XUX6 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Skint2A7XUX6 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Skint2A7XUX6 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Skint2A7XUX6 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Skint2A7XUX6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Skint2A7XUX6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Skint2A7XUX6 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Skint2A7XUX6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Skint2A7XUX6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Skint2A7XUX6 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Skint2A7XUX6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Skint2A7XUX6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Skint2A7XUX6 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Skint2A7XUX6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Skint2A7XUX6 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Skint2A7XUX6 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Skint2A7XUX6 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Skint2A7XUX6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Skint2A7XUX6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Skint2A7XUX6 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Skint2A7XUX6 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Skint2A7XUX6 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Skint2A7XUX6 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Skint2A7XUX6 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Skint2A7XUX6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Skint2A7XUX6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Skint2A7XUX6 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Skint2A7XUX6 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Skint2A7XUX6 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Skint2A7XUX6 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Skint2A7XUX6 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Skint2A7XUX6 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Skint2A7XUX6 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Skint2A7XUX6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Skint2A7XUX6 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Skint2A7XUX6 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Skint2A7XUX6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Skint2A7XUX6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Skint2A7XUX6 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Skint2A7XUX6 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Skint2A7XUX6 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Skint2A7XUX6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Skint2A7XUX6 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Skint2A7XUX6 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Skint2A7XUX6 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Skint2A7XUX6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Skint2A7XUX6 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Skint2A7XUX6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Skint2A7XUX6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Skint2A7XUX6 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Skint2A7XUX6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Skint2A7XUX6 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Skint2A7XUX6 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Skint2A7XUX6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Skint2A7XUX6 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Skint2A7XUX6 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Skint2A7XUX6 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Skint2A7XUX6 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Skint2A7XUX6 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Skint2A7XUX6 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Skint2A7XUX6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Skint2A7XUX6 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Skint2A7XUX6 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Skint2A7XUX6 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Skint2A7XUX6 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Skint2A7XUX6 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Skint2A7XUX6 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Skint2A7XUX6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Skint2A7XUX6 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Skint2A7XUX6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Skint2A7XUX6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Skint2A7XUX6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Skint2A7XUX6 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Skint2A7XUX6 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Skint2A7XUX6 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Skint2A7XUX6 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Skint2A7XUX6 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Skint2A7XUX6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Skint2A7XUX6 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Skint2A7XUX6 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Skint2A7XUX6 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Skint2A7XUX6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Skint2A7XUX6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Skint2A7XUX6 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Skint2A7XUX6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Skint2A7XUX6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Skint2A7XUX6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Skint2A7XUX6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Skint2A7XUX6 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Skint2A7XUX6 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Skint2A7XUX6 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms