Protein–RNA interactions for Protein: A6X8Z9

4930435E12Rik, RIKEN cDNA 4930435E12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930435E12RikA6X8Z9 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
4930435E12RikA6X8Z9 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
4930435E12RikA6X8Z9 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4930435E12RikA6X8Z9 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4930435E12RikA6X8Z9 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4930435E12RikA6X8Z9 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
4930435E12RikA6X8Z9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
4930435E12RikA6X8Z9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4930435E12RikA6X8Z9 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4930435E12RikA6X8Z9 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
4930435E12RikA6X8Z9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4930435E12RikA6X8Z9 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4930435E12RikA6X8Z9 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4930435E12RikA6X8Z9 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
4930435E12RikA6X8Z9 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
4930435E12RikA6X8Z9 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
4930435E12RikA6X8Z9 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
4930435E12RikA6X8Z9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
4930435E12RikA6X8Z9 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
4930435E12RikA6X8Z9 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
4930435E12RikA6X8Z9 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
4930435E12RikA6X8Z9 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
4930435E12RikA6X8Z9 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
4930435E12RikA6X8Z9 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
4930435E12RikA6X8Z9 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
4930435E12RikA6X8Z9 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
4930435E12RikA6X8Z9 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
4930435E12RikA6X8Z9 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930435E12RikA6X8Z9 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930435E12RikA6X8Z9 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930435E12RikA6X8Z9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms