Protein–RNA interactions for Protein: A2APU8

Fam205a, Protein FAM205A, mousemouse

Predictions only

Length 1,308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam205aA2APU8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fam205aA2APU8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fam205aA2APU8 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fam205aA2APU8 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fam205aA2APU8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Fam205aA2APU8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fam205aA2APU8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fam205aA2APU8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fam205aA2APU8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fam205aA2APU8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fam205aA2APU8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fam205aA2APU8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fam205aA2APU8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fam205aA2APU8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fam205aA2APU8 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Fam205aA2APU8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fam205aA2APU8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam205aA2APU8 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam205aA2APU8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam205aA2APU8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam205aA2APU8 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam205aA2APU8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam205aA2APU8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam205aA2APU8 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam205aA2APU8 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam205aA2APU8 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam205aA2APU8 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam205aA2APU8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fam205aA2APU8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fam205aA2APU8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fam205aA2APU8 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fam205aA2APU8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fam205aA2APU8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fam205aA2APU8 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fam205aA2APU8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fam205aA2APU8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Fam205aA2APU8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fam205aA2APU8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fam205aA2APU8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fam205aA2APU8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fam205aA2APU8 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fam205aA2APU8 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fam205aA2APU8 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fam205aA2APU8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fam205aA2APU8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fam205aA2APU8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fam205aA2APU8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fam205aA2APU8 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Fam205aA2APU8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fam205aA2APU8 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fam205aA2APU8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fam205aA2APU8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam205aA2APU8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam205aA2APU8 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam205aA2APU8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam205aA2APU8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam205aA2APU8 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam205aA2APU8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam205aA2APU8 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam205aA2APU8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam205aA2APU8 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam205aA2APU8 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam205aA2APU8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam205aA2APU8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam205aA2APU8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam205aA2APU8 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam205aA2APU8 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam205aA2APU8 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam205aA2APU8 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam205aA2APU8 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam205aA2APU8 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam205aA2APU8 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam205aA2APU8 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam205aA2APU8 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam205aA2APU8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam205aA2APU8 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam205aA2APU8 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam205aA2APU8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam205aA2APU8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam205aA2APU8 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam205aA2APU8 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam205aA2APU8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam205aA2APU8 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam205aA2APU8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam205aA2APU8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam205aA2APU8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam205aA2APU8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Fam205aA2APU8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam205aA2APU8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam205aA2APU8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam205aA2APU8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam205aA2APU8 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam205aA2APU8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam205aA2APU8 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam205aA2APU8 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam205aA2APU8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam205aA2APU8 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam205aA2APU8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam205aA2APU8 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam205aA2APU8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms