Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CtcflA2APF3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CtcflA2APF3 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CtcflA2APF3 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CtcflA2APF3 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CtcflA2APF3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CtcflA2APF3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CtcflA2APF3 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CtcflA2APF3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CtcflA2APF3 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CtcflA2APF3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CtcflA2APF3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CtcflA2APF3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CtcflA2APF3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CtcflA2APF3 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CtcflA2APF3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CtcflA2APF3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
CtcflA2APF3 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CtcflA2APF3 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CtcflA2APF3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CtcflA2APF3 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CtcflA2APF3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CtcflA2APF3 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CtcflA2APF3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CtcflA2APF3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CtcflA2APF3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CtcflA2APF3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CtcflA2APF3 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CtcflA2APF3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CtcflA2APF3 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CtcflA2APF3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CtcflA2APF3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CtcflA2APF3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CtcflA2APF3 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CtcflA2APF3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CtcflA2APF3 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CtcflA2APF3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CtcflA2APF3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CtcflA2APF3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CtcflA2APF3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CtcflA2APF3 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CtcflA2APF3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CtcflA2APF3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CtcflA2APF3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CtcflA2APF3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CtcflA2APF3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CtcflA2APF3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CtcflA2APF3 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CtcflA2APF3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtcflA2APF3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtcflA2APF3 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtcflA2APF3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtcflA2APF3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtcflA2APF3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtcflA2APF3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtcflA2APF3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtcflA2APF3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CtcflA2APF3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtcflA2APF3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtcflA2APF3 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtcflA2APF3 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtcflA2APF3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtcflA2APF3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CtcflA2APF3 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CtcflA2APF3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CtcflA2APF3 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CtcflA2APF3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CtcflA2APF3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CtcflA2APF3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CtcflA2APF3 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CtcflA2APF3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CtcflA2APF3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CtcflA2APF3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CtcflA2APF3 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CtcflA2APF3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CtcflA2APF3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CtcflA2APF3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CtcflA2APF3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CtcflA2APF3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CtcflA2APF3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CtcflA2APF3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CtcflA2APF3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CtcflA2APF3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CtcflA2APF3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CtcflA2APF3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CtcflA2APF3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CtcflA2APF3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CtcflA2APF3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CtcflA2APF3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CtcflA2APF3 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CtcflA2APF3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CtcflA2APF3 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CtcflA2APF3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CtcflA2APF3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CtcflA2APF3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CtcflA2APF3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CtcflA2APF3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CtcflA2APF3 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CtcflA2APF3 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CtcflA2APF3 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
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