Protein–RNA interactions for Protein: A2AJN7

Slc4a11, Sodium bicarbonate transporter-like protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc4a11A2AJN7 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc4a11A2AJN7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc4a11A2AJN7 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc4a11A2AJN7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc4a11A2AJN7 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc4a11A2AJN7 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc4a11A2AJN7 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc4a11A2AJN7 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc4a11A2AJN7 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc4a11A2AJN7 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc4a11A2AJN7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc4a11A2AJN7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc4a11A2AJN7 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc4a11A2AJN7 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc4a11A2AJN7 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc4a11A2AJN7 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc4a11A2AJN7 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc4a11A2AJN7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc4a11A2AJN7 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc4a11A2AJN7 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc4a11A2AJN7 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc4a11A2AJN7 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc4a11A2AJN7 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc4a11A2AJN7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc4a11A2AJN7 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc4a11A2AJN7 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc4a11A2AJN7 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc4a11A2AJN7 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc4a11A2AJN7 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc4a11A2AJN7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc4a11A2AJN7 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc4a11A2AJN7 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc4a11A2AJN7 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc4a11A2AJN7 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc4a11A2AJN7 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc4a11A2AJN7 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc4a11A2AJN7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc4a11A2AJN7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc4a11A2AJN7 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc4a11A2AJN7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc4a11A2AJN7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc4a11A2AJN7 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc4a11A2AJN7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc4a11A2AJN7 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc4a11A2AJN7 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc4a11A2AJN7 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc4a11A2AJN7 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc4a11A2AJN7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc4a11A2AJN7 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc4a11A2AJN7 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc4a11A2AJN7 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc4a11A2AJN7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc4a11A2AJN7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc4a11A2AJN7 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc4a11A2AJN7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc4a11A2AJN7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc4a11A2AJN7 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc4a11A2AJN7 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc4a11A2AJN7 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc4a11A2AJN7 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc4a11A2AJN7 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc4a11A2AJN7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc4a11A2AJN7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc4a11A2AJN7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc4a11A2AJN7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc4a11A2AJN7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Slc4a11A2AJN7 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc4a11A2AJN7 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc4a11A2AJN7 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc4a11A2AJN7 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc4a11A2AJN7 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc4a11A2AJN7 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc4a11A2AJN7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc4a11A2AJN7 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc4a11A2AJN7 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc4a11A2AJN7 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc4a11A2AJN7 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc4a11A2AJN7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc4a11A2AJN7 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc4a11A2AJN7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc4a11A2AJN7 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc4a11A2AJN7 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc4a11A2AJN7 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc4a11A2AJN7 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc4a11A2AJN7 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc4a11A2AJN7 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc4a11A2AJN7 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc4a11A2AJN7 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc4a11A2AJN7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc4a11A2AJN7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc4a11A2AJN7 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc4a11A2AJN7 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc4a11A2AJN7 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc4a11A2AJN7 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc4a11A2AJN7 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc4a11A2AJN7 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc4a11A2AJN7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc4a11A2AJN7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc4a11A2AJN7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc4a11A2AJN7 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms