Protein–RNA interactions for Protein: A2AJ77

Prdm12, PR domain zinc finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm12A2AJ77 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prdm12A2AJ77 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prdm12A2AJ77 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prdm12A2AJ77 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prdm12A2AJ77 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Prdm12A2AJ77 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prdm12A2AJ77 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Prdm12A2AJ77 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prdm12A2AJ77 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prdm12A2AJ77 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prdm12A2AJ77 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prdm12A2AJ77 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prdm12A2AJ77 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prdm12A2AJ77 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prdm12A2AJ77 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prdm12A2AJ77 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prdm12A2AJ77 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prdm12A2AJ77 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prdm12A2AJ77 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prdm12A2AJ77 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prdm12A2AJ77 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prdm12A2AJ77 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prdm12A2AJ77 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prdm12A2AJ77 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prdm12A2AJ77 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prdm12A2AJ77 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prdm12A2AJ77 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prdm12A2AJ77 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prdm12A2AJ77 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Prdm12A2AJ77 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Prdm12A2AJ77 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Prdm12A2AJ77 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prdm12A2AJ77 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prdm12A2AJ77 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prdm12A2AJ77 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prdm12A2AJ77 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prdm12A2AJ77 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prdm12A2AJ77 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Prdm12A2AJ77 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prdm12A2AJ77 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Prdm12A2AJ77 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Prdm12A2AJ77 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prdm12A2AJ77 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prdm12A2AJ77 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prdm12A2AJ77 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prdm12A2AJ77 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prdm12A2AJ77 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prdm12A2AJ77 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prdm12A2AJ77 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prdm12A2AJ77 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Prdm12A2AJ77 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prdm12A2AJ77 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prdm12A2AJ77 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prdm12A2AJ77 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prdm12A2AJ77 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prdm12A2AJ77 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prdm12A2AJ77 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prdm12A2AJ77 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prdm12A2AJ77 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prdm12A2AJ77 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prdm12A2AJ77 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prdm12A2AJ77 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prdm12A2AJ77 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prdm12A2AJ77 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prdm12A2AJ77 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prdm12A2AJ77 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prdm12A2AJ77 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prdm12A2AJ77 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prdm12A2AJ77 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prdm12A2AJ77 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prdm12A2AJ77 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prdm12A2AJ77 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prdm12A2AJ77 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prdm12A2AJ77 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prdm12A2AJ77 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prdm12A2AJ77 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prdm12A2AJ77 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Prdm12A2AJ77 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prdm12A2AJ77 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prdm12A2AJ77 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prdm12A2AJ77 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Prdm12A2AJ77 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prdm12A2AJ77 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Prdm12A2AJ77 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prdm12A2AJ77 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Prdm12A2AJ77 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prdm12A2AJ77 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prdm12A2AJ77 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prdm12A2AJ77 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prdm12A2AJ77 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prdm12A2AJ77 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prdm12A2AJ77 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prdm12A2AJ77 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prdm12A2AJ77 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prdm12A2AJ77 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prdm12A2AJ77 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prdm12A2AJ77 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prdm12A2AJ77 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prdm12A2AJ77 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prdm12A2AJ77 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms