Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Frmpd4A2AFR3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Frmpd4A2AFR3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Frmpd4A2AFR3 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Frmpd4A2AFR3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Frmpd4A2AFR3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Frmpd4A2AFR3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Frmpd4A2AFR3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Frmpd4A2AFR3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Frmpd4A2AFR3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Frmpd4A2AFR3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Frmpd4A2AFR3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Frmpd4A2AFR3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Frmpd4A2AFR3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Frmpd4A2AFR3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Frmpd4A2AFR3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Frmpd4A2AFR3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Frmpd4A2AFR3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Frmpd4A2AFR3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Frmpd4A2AFR3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Frmpd4A2AFR3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Frmpd4A2AFR3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Frmpd4A2AFR3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Frmpd4A2AFR3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Frmpd4A2AFR3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Frmpd4A2AFR3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Frmpd4A2AFR3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Frmpd4A2AFR3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Frmpd4A2AFR3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Frmpd4A2AFR3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Frmpd4A2AFR3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Frmpd4A2AFR3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Frmpd4A2AFR3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Frmpd4A2AFR3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Frmpd4A2AFR3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Frmpd4A2AFR3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Frmpd4A2AFR3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Frmpd4A2AFR3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Frmpd4A2AFR3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Frmpd4A2AFR3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Frmpd4A2AFR3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Frmpd4A2AFR3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Frmpd4A2AFR3 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Frmpd4A2AFR3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Frmpd4A2AFR3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Frmpd4A2AFR3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Frmpd4A2AFR3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Frmpd4A2AFR3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Frmpd4A2AFR3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Frmpd4A2AFR3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Frmpd4A2AFR3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Frmpd4A2AFR3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Frmpd4A2AFR3 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Frmpd4A2AFR3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Frmpd4A2AFR3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Frmpd4A2AFR3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Frmpd4A2AFR3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Frmpd4A2AFR3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Frmpd4A2AFR3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Frmpd4A2AFR3 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Frmpd4A2AFR3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Frmpd4A2AFR3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Frmpd4A2AFR3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Frmpd4A2AFR3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Frmpd4A2AFR3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Frmpd4A2AFR3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Frmpd4A2AFR3 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Frmpd4A2AFR3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Frmpd4A2AFR3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Frmpd4A2AFR3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Frmpd4A2AFR3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Frmpd4A2AFR3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Frmpd4A2AFR3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Frmpd4A2AFR3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Frmpd4A2AFR3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Frmpd4A2AFR3 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Frmpd4A2AFR3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Frmpd4A2AFR3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Frmpd4A2AFR3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Frmpd4A2AFR3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Frmpd4A2AFR3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Frmpd4A2AFR3 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Frmpd4A2AFR3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Frmpd4A2AFR3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Frmpd4A2AFR3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Frmpd4A2AFR3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Frmpd4A2AFR3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Frmpd4A2AFR3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Frmpd4A2AFR3 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Frmpd4A2AFR3 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Frmpd4A2AFR3 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Frmpd4A2AFR3 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Frmpd4A2AFR3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Frmpd4A2AFR3 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Frmpd4A2AFR3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Frmpd4A2AFR3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Frmpd4A2AFR3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Frmpd4A2AFR3 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Frmpd4A2AFR3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Frmpd4A2AFR3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.5 ms