Protein–RNA interactions for Protein: A2AF53

Tmem185a, Transmembrane protein 185A, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem185aA2AF53 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem185aA2AF53 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem185aA2AF53 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem185aA2AF53 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem185aA2AF53 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem185aA2AF53 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem185aA2AF53 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem185aA2AF53 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem185aA2AF53 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmem185aA2AF53 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmem185aA2AF53 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmem185aA2AF53 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmem185aA2AF53 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmem185aA2AF53 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmem185aA2AF53 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmem185aA2AF53 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmem185aA2AF53 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmem185aA2AF53 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmem185aA2AF53 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmem185aA2AF53 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Tmem185aA2AF53 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tmem185aA2AF53 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tmem185aA2AF53 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tmem185aA2AF53 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tmem185aA2AF53 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem185aA2AF53 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem185aA2AF53 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem185aA2AF53 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem185aA2AF53 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem185aA2AF53 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem185aA2AF53 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem185aA2AF53 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem185aA2AF53 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem185aA2AF53 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem185aA2AF53 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem185aA2AF53 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem185aA2AF53 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem185aA2AF53 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem185aA2AF53 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem185aA2AF53 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem185aA2AF53 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem185aA2AF53 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem185aA2AF53 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem185aA2AF53 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem185aA2AF53 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem185aA2AF53 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem185aA2AF53 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem185aA2AF53 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem185aA2AF53 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem185aA2AF53 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem185aA2AF53 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem185aA2AF53 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem185aA2AF53 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem185aA2AF53 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem185aA2AF53 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem185aA2AF53 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem185aA2AF53 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem185aA2AF53 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem185aA2AF53 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem185aA2AF53 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem185aA2AF53 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem185aA2AF53 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem185aA2AF53 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem185aA2AF53 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem185aA2AF53 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem185aA2AF53 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem185aA2AF53 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem185aA2AF53 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem185aA2AF53 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem185aA2AF53 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem185aA2AF53 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem185aA2AF53 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem185aA2AF53 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmem185aA2AF53 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmem185aA2AF53 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmem185aA2AF53 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmem185aA2AF53 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmem185aA2AF53 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmem185aA2AF53 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmem185aA2AF53 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmem185aA2AF53 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmem185aA2AF53 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmem185aA2AF53 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmem185aA2AF53 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmem185aA2AF53 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmem185aA2AF53 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmem185aA2AF53 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmem185aA2AF53 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmem185aA2AF53 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmem185aA2AF53 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmem185aA2AF53 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmem185aA2AF53 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmem185aA2AF53 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmem185aA2AF53 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmem185aA2AF53 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmem185aA2AF53 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmem185aA2AF53 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmem185aA2AF53 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmem185aA2AF53 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmem185aA2AF53 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms