Protein–RNA interactions for Protein: A2AE42

Cyb561d1, Cytochrome b561 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyb561d1A2AE42 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyb561d1A2AE42 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyb561d1A2AE42 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyb561d1A2AE42 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyb561d1A2AE42 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyb561d1A2AE42 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyb561d1A2AE42 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyb561d1A2AE42 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyb561d1A2AE42 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyb561d1A2AE42 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyb561d1A2AE42 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyb561d1A2AE42 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyb561d1A2AE42 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyb561d1A2AE42 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyb561d1A2AE42 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyb561d1A2AE42 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyb561d1A2AE42 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyb561d1A2AE42 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyb561d1A2AE42 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyb561d1A2AE42 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyb561d1A2AE42 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyb561d1A2AE42 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyb561d1A2AE42 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyb561d1A2AE42 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cyb561d1A2AE42 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cyb561d1A2AE42 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cyb561d1A2AE42 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cyb561d1A2AE42 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cyb561d1A2AE42 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cyb561d1A2AE42 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cyb561d1A2AE42 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cyb561d1A2AE42 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cyb561d1A2AE42 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cyb561d1A2AE42 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cyb561d1A2AE42 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cyb561d1A2AE42 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cyb561d1A2AE42 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cyb561d1A2AE42 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cyb561d1A2AE42 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cyb561d1A2AE42 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cyb561d1A2AE42 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cyb561d1A2AE42 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cyb561d1A2AE42 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cyb561d1A2AE42 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cyb561d1A2AE42 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cyb561d1A2AE42 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cyb561d1A2AE42 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cyb561d1A2AE42 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cyb561d1A2AE42 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cyb561d1A2AE42 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cyb561d1A2AE42 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cyb561d1A2AE42 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cyb561d1A2AE42 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cyb561d1A2AE42 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cyb561d1A2AE42 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cyb561d1A2AE42 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cyb561d1A2AE42 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cyb561d1A2AE42 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cyb561d1A2AE42 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cyb561d1A2AE42 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cyb561d1A2AE42 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cyb561d1A2AE42 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cyb561d1A2AE42 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cyb561d1A2AE42 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cyb561d1A2AE42 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cyb561d1A2AE42 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cyb561d1A2AE42 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cyb561d1A2AE42 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cyb561d1A2AE42 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cyb561d1A2AE42 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cyb561d1A2AE42 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cyb561d1A2AE42 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cyb561d1A2AE42 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cyb561d1A2AE42 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cyb561d1A2AE42 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cyb561d1A2AE42 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyb561d1A2AE42 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyb561d1A2AE42 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyb561d1A2AE42 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyb561d1A2AE42 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyb561d1A2AE42 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyb561d1A2AE42 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyb561d1A2AE42 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyb561d1A2AE42 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyb561d1A2AE42 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyb561d1A2AE42 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyb561d1A2AE42 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyb561d1A2AE42 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyb561d1A2AE42 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyb561d1A2AE42 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyb561d1A2AE42 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyb561d1A2AE42 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyb561d1A2AE42 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyb561d1A2AE42 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyb561d1A2AE42 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyb561d1A2AE42 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyb561d1A2AE42 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyb561d1A2AE42 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyb561d1A2AE42 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyb561d1A2AE42 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms