Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PtprfA2A8L5 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PtprfA2A8L5 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PtprfA2A8L5 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PtprfA2A8L5 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PtprfA2A8L5 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PtprfA2A8L5 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PtprfA2A8L5 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PtprfA2A8L5 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PtprfA2A8L5 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PtprfA2A8L5 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PtprfA2A8L5 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PtprfA2A8L5 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PtprfA2A8L5 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PtprfA2A8L5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PtprfA2A8L5 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PtprfA2A8L5 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PtprfA2A8L5 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PtprfA2A8L5 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PtprfA2A8L5 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PtprfA2A8L5 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PtprfA2A8L5 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PtprfA2A8L5 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PtprfA2A8L5 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PtprfA2A8L5 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PtprfA2A8L5 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PtprfA2A8L5 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PtprfA2A8L5 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
PtprfA2A8L5 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
PtprfA2A8L5 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PtprfA2A8L5 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PtprfA2A8L5 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PtprfA2A8L5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PtprfA2A8L5 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
PtprfA2A8L5 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PtprfA2A8L5 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
PtprfA2A8L5 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
PtprfA2A8L5 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PtprfA2A8L5 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PtprfA2A8L5 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PtprfA2A8L5 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PtprfA2A8L5 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PtprfA2A8L5 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PtprfA2A8L5 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PtprfA2A8L5 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PtprfA2A8L5 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PtprfA2A8L5 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PtprfA2A8L5 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PtprfA2A8L5 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PtprfA2A8L5 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PtprfA2A8L5 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PtprfA2A8L5 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PtprfA2A8L5 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PtprfA2A8L5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PtprfA2A8L5 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
PtprfA2A8L5 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PtprfA2A8L5 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PtprfA2A8L5 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PtprfA2A8L5 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PtprfA2A8L5 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PtprfA2A8L5 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PtprfA2A8L5 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
PtprfA2A8L5 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PtprfA2A8L5 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PtprfA2A8L5 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PtprfA2A8L5 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PtprfA2A8L5 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PtprfA2A8L5 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
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PtprfA2A8L5 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PtprfA2A8L5 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PtprfA2A8L5 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PtprfA2A8L5 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PtprfA2A8L5 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PtprfA2A8L5 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
PtprfA2A8L5 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PtprfA2A8L5 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PtprfA2A8L5 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PtprfA2A8L5 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PtprfA2A8L5 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PtprfA2A8L5 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PtprfA2A8L5 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PtprfA2A8L5 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PtprfA2A8L5 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PtprfA2A8L5 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PtprfA2A8L5 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PtprfA2A8L5 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PtprfA2A8L5 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PtprfA2A8L5 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PtprfA2A8L5 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PtprfA2A8L5 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PtprfA2A8L5 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PtprfA2A8L5 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PtprfA2A8L5 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PtprfA2A8L5 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PtprfA2A8L5 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PtprfA2A8L5 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PtprfA2A8L5 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PtprfA2A8L5 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PtprfA2A8L5 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms