Protein–RNA interactions for Protein: A2A6M5

Calcoco2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calcoco2A2A6M5 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Calcoco2A2A6M5 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Calcoco2A2A6M5 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Calcoco2A2A6M5 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Calcoco2A2A6M5 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Calcoco2A2A6M5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Calcoco2A2A6M5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Calcoco2A2A6M5 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Calcoco2A2A6M5 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Calcoco2A2A6M5 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Calcoco2A2A6M5 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Calcoco2A2A6M5 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Calcoco2A2A6M5 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Calcoco2A2A6M5 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Calcoco2A2A6M5 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Calcoco2A2A6M5 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Calcoco2A2A6M5 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Calcoco2A2A6M5 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Calcoco2A2A6M5 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Calcoco2A2A6M5 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Calcoco2A2A6M5 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Calcoco2A2A6M5 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Calcoco2A2A6M5 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Calcoco2A2A6M5 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Calcoco2A2A6M5 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Calcoco2A2A6M5 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Calcoco2A2A6M5 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Calcoco2A2A6M5 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Calcoco2A2A6M5 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Calcoco2A2A6M5 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Calcoco2A2A6M5 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Calcoco2A2A6M5 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Calcoco2A2A6M5 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Calcoco2A2A6M5 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Calcoco2A2A6M5 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Calcoco2A2A6M5 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Calcoco2A2A6M5 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Calcoco2A2A6M5 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Calcoco2A2A6M5 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Calcoco2A2A6M5 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Calcoco2A2A6M5 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Calcoco2A2A6M5 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Calcoco2A2A6M5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Calcoco2A2A6M5 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Calcoco2A2A6M5 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Calcoco2A2A6M5 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Calcoco2A2A6M5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Calcoco2A2A6M5 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Calcoco2A2A6M5 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Calcoco2A2A6M5 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Calcoco2A2A6M5 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Calcoco2A2A6M5 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Calcoco2A2A6M5 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Calcoco2A2A6M5 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Calcoco2A2A6M5 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Calcoco2A2A6M5 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Calcoco2A2A6M5 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Calcoco2A2A6M5 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Calcoco2A2A6M5 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Calcoco2A2A6M5 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Calcoco2A2A6M5 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Calcoco2A2A6M5 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Calcoco2A2A6M5 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Calcoco2A2A6M5 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Calcoco2A2A6M5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Calcoco2A2A6M5 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Calcoco2A2A6M5 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Calcoco2A2A6M5 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Calcoco2A2A6M5 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Calcoco2A2A6M5 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Calcoco2A2A6M5 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Calcoco2A2A6M5 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Calcoco2A2A6M5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Calcoco2A2A6M5 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Calcoco2A2A6M5 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Calcoco2A2A6M5 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Calcoco2A2A6M5 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Calcoco2A2A6M5 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Calcoco2A2A6M5 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Calcoco2A2A6M5 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Calcoco2A2A6M5 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Calcoco2A2A6M5 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Calcoco2A2A6M5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Calcoco2A2A6M5 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Calcoco2A2A6M5 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Calcoco2A2A6M5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Calcoco2A2A6M5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Calcoco2A2A6M5 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Calcoco2A2A6M5 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Calcoco2A2A6M5 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Calcoco2A2A6M5 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Calcoco2A2A6M5 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Calcoco2A2A6M5 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Calcoco2A2A6M5 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Calcoco2A2A6M5 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Calcoco2A2A6M5 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Calcoco2A2A6M5 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Calcoco2A2A6M5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Calcoco2A2A6M5 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Calcoco2A2A6M5 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms