Protein–RNA interactions for Protein: A2A432

Cul4b, Cullin-4B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 970 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul4bA2A432 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cul4bA2A432 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cul4bA2A432 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cul4bA2A432 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cul4bA2A432 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cul4bA2A432 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cul4bA2A432 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cul4bA2A432 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cul4bA2A432 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cul4bA2A432 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cul4bA2A432 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cul4bA2A432 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cul4bA2A432 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cul4bA2A432 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cul4bA2A432 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cul4bA2A432 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cul4bA2A432 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cul4bA2A432 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cul4bA2A432 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cul4bA2A432 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cul4bA2A432 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cul4bA2A432 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cul4bA2A432 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cul4bA2A432 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cul4bA2A432 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cul4bA2A432 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cul4bA2A432 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cul4bA2A432 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Cul4bA2A432 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Cul4bA2A432 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cul4bA2A432 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cul4bA2A432 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cul4bA2A432 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cul4bA2A432 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cul4bA2A432 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cul4bA2A432 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cul4bA2A432 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Cul4bA2A432 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cul4bA2A432 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Cul4bA2A432 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cul4bA2A432 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cul4bA2A432 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cul4bA2A432 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cul4bA2A432 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cul4bA2A432 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Cul4bA2A432 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cul4bA2A432 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cul4bA2A432 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cul4bA2A432 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cul4bA2A432 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cul4bA2A432 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cul4bA2A432 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cul4bA2A432 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cul4bA2A432 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cul4bA2A432 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cul4bA2A432 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cul4bA2A432 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cul4bA2A432 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cul4bA2A432 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cul4bA2A432 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cul4bA2A432 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cul4bA2A432 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Cul4bA2A432 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cul4bA2A432 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cul4bA2A432 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cul4bA2A432 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cul4bA2A432 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cul4bA2A432 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cul4bA2A432 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Cul4bA2A432 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cul4bA2A432 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cul4bA2A432 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cul4bA2A432 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cul4bA2A432 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cul4bA2A432 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cul4bA2A432 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cul4bA2A432 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cul4bA2A432 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cul4bA2A432 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cul4bA2A432 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cul4bA2A432 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cul4bA2A432 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cul4bA2A432 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cul4bA2A432 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cul4bA2A432 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cul4bA2A432 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cul4bA2A432 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cul4bA2A432 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cul4bA2A432 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cul4bA2A432 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cul4bA2A432 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cul4bA2A432 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cul4bA2A432 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cul4bA2A432 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cul4bA2A432 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cul4bA2A432 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cul4bA2A432 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cul4bA2A432 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cul4bA2A432 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Cul4bA2A432 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms