Protein–RNA interactions for Protein: A1Z198

Nlrp1b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1b allele 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1bA1Z198 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nlrp1bA1Z198 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nlrp1bA1Z198 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nlrp1bA1Z198 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nlrp1bA1Z198 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nlrp1bA1Z198 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nlrp1bA1Z198 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nlrp1bA1Z198 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nlrp1bA1Z198 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nlrp1bA1Z198 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nlrp1bA1Z198 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nlrp1bA1Z198 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nlrp1bA1Z198 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nlrp1bA1Z198 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nlrp1bA1Z198 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nlrp1bA1Z198 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nlrp1bA1Z198 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nlrp1bA1Z198 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nlrp1bA1Z198 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nlrp1bA1Z198 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nlrp1bA1Z198 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nlrp1bA1Z198 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nlrp1bA1Z198 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nlrp1bA1Z198 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nlrp1bA1Z198 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nlrp1bA1Z198 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nlrp1bA1Z198 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nlrp1bA1Z198 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Nlrp1bA1Z198 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Nlrp1bA1Z198 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nlrp1bA1Z198 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nlrp1bA1Z198 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nlrp1bA1Z198 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nlrp1bA1Z198 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nlrp1bA1Z198 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Nlrp1bA1Z198 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nlrp1bA1Z198 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nlrp1bA1Z198 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nlrp1bA1Z198 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nlrp1bA1Z198 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nlrp1bA1Z198 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nlrp1bA1Z198 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nlrp1bA1Z198 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nlrp1bA1Z198 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nlrp1bA1Z198 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nlrp1bA1Z198 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nlrp1bA1Z198 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nlrp1bA1Z198 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nlrp1bA1Z198 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nlrp1bA1Z198 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nlrp1bA1Z198 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nlrp1bA1Z198 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nlrp1bA1Z198 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nlrp1bA1Z198 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nlrp1bA1Z198 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nlrp1bA1Z198 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nlrp1bA1Z198 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nlrp1bA1Z198 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nlrp1bA1Z198 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nlrp1bA1Z198 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Nlrp1bA1Z198 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Nlrp1bA1Z198 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nlrp1bA1Z198 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nlrp1bA1Z198 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nlrp1bA1Z198 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nlrp1bA1Z198 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nlrp1bA1Z198 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nlrp1bA1Z198 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nlrp1bA1Z198 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nlrp1bA1Z198 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nlrp1bA1Z198 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nlrp1bA1Z198 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nlrp1bA1Z198 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nlrp1bA1Z198 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nlrp1bA1Z198 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nlrp1bA1Z198 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nlrp1bA1Z198 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nlrp1bA1Z198 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nlrp1bA1Z198 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nlrp1bA1Z198 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nlrp1bA1Z198 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nlrp1bA1Z198 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nlrp1bA1Z198 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nlrp1bA1Z198 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Nlrp1bA1Z198 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nlrp1bA1Z198 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nlrp1bA1Z198 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nlrp1bA1Z198 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nlrp1bA1Z198 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nlrp1bA1Z198 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nlrp1bA1Z198 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nlrp1bA1Z198 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Nlrp1bA1Z198 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nlrp1bA1Z198 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nlrp1bA1Z198 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nlrp1bA1Z198 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nlrp1bA1Z198 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nlrp1bA1Z198 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nlrp1bA1Z198 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nlrp1bA1Z198 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms