Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YVH6

1520401A03Rik, RIKEN cDNA 1520401A03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.06■□□□□ 0
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1520401A03RikA0A0J9YVH6 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1520401A03RikA0A0J9YVH6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC15.04■□□□□ -0
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1520401A03RikA0A0J9YVH6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.03■□□□□ -0
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
1520401A03RikA0A0J9YVH6 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.02■□□□□ -0
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
1520401A03RikA0A0J9YVH6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
1520401A03RikA0A0J9YVH6 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
1520401A03RikA0A0J9YVH6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
1520401A03RikA0A0J9YVH6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms