Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Tlr5Q9JLF7 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tlr5Q9JLF7 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tlr5Q9JLF7 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tlr5Q9JLF7 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tlr5Q9JLF7 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tlr5Q9JLF7 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tlr5Q9JLF7 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tlr5Q9JLF7 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tlr5Q9JLF7 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tlr5Q9JLF7 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tlr5Q9JLF7 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Tlr5Q9JLF7 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tlr5Q9JLF7 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tlr5Q9JLF7 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tlr5Q9JLF7 Gm42815-201ENSMUST00000198787 1470 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Tlr5Q9JLF7 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tlr5Q9JLF7 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tlr5Q9JLF7 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tlr5Q9JLF7 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Tlr5Q9JLF7 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tlr5Q9JLF7 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tlr5Q9JLF7 Glb1l-201ENSMUST00000113623 2339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Tlr5Q9JLF7 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tlr5Q9JLF7 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tlr5Q9JLF7 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tlr5Q9JLF7 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tlr5Q9JLF7 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tlr5Q9JLF7 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tlr5Q9JLF7 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Tlr5Q9JLF7 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tlr5Q9JLF7 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Tlr5Q9JLF7 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Tlr5Q9JLF7 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tlr5Q9JLF7 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tlr5Q9JLF7 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Tlr5Q9JLF7 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Tlr5Q9JLF7 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Tlr5Q9JLF7 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Tlr5Q9JLF7 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Tlr5Q9JLF7 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Tlr5Q9JLF7 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Tlr5Q9JLF7 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tlr5Q9JLF7 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Tlr5Q9JLF7 Gm28032-201ENSMUST00000184104 96 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Tlr5Q9JLF7 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tlr5Q9JLF7 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Tlr5Q9JLF7 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tlr5Q9JLF7 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Tlr5Q9JLF7 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Tlr5Q9JLF7 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Tlr5Q9JLF7 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tlr5Q9JLF7 Id2-203ENSMUST00000222667 958 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Tlr5Q9JLF7 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tlr5Q9JLF7 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Tlr5Q9JLF7 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tlr5Q9JLF7 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tlr5Q9JLF7 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tlr5Q9JLF7 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tlr5Q9JLF7 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tlr5Q9JLF7 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tlr5Q9JLF7 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tlr5Q9JLF7 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Tlr5Q9JLF7 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tlr5Q9JLF7 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tlr5Q9JLF7 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tlr5Q9JLF7 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tlr5Q9JLF7 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tlr5Q9JLF7 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Tlr5Q9JLF7 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Tlr5Q9JLF7 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tlr5Q9JLF7 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tlr5Q9JLF7 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tlr5Q9JLF7 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tlr5Q9JLF7 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tlr5Q9JLF7 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tlr5Q9JLF7 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tlr5Q9JLF7 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tlr5Q9JLF7 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tlr5Q9JLF7 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tlr5Q9JLF7 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tlr5Q9JLF7 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Tlr5Q9JLF7 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tlr5Q9JLF7 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tlr5Q9JLF7 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tlr5Q9JLF7 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Tlr5Q9JLF7 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tlr5Q9JLF7 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tlr5Q9JLF7 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Tlr5Q9JLF7 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tlr5Q9JLF7 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tlr5Q9JLF7 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Tlr5Q9JLF7 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tlr5Q9JLF7 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Tlr5Q9JLF7 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Tlr5Q9JLF7 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Tlr5Q9JLF7 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tlr5Q9JLF7 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tlr5Q9JLF7 Gm25580-201ENSMUST00000083409 327 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Tlr5Q9JLF7 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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